RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554426.5

CKB-208, Transcript of creatine kinase B, human

TSL 5

Gene CKB, Length 775 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CKB-208	ENST00000554426	ADGRL2	O95490	1459 aa		41.11	■■■■■ 4.17
CKB-208	ENST00000554426	ZFYVE9	O95405	1425 aa		41.08	■■■■■ 4.17
CKB-208	ENST00000554426	BCAN	Q96GW7	911 aa		41.07	■■■■■ 4.17
CKB-208	ENST00000554426	MSH6	P52701	1360 aa		41.06	■■■■■ 4.16
CKB-208	ENST00000554426	SLAIN2	Q9P270	581 aa		41.04	■■■■■ 4.16
CKB-208	ENST00000554426	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	41.02	■■■■■ 4.16
CKB-208	ENST00000554426	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		41.02	■■■■■ 4.16
CKB-208	ENST00000554426	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		41	■■■■■ 4.15
CKB-208	ENST00000554426	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		40.99	■■■■■ 4.15
CKB-208	ENST00000554426	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.94	■■■■■ 4.14
CKB-208	ENST00000554426	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CKB-208	ENST00000554426	PHLPP1	O60346	1717 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CKB-208	ENST00000554426	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CKB-208	ENST00000554426	JCAD	Q9P266	1359 aa		40.92	■■■■■ 4.14
CKB-208	ENST00000554426	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	40.92	■■■■■ 4.14
CKB-208	ENST00000554426	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	40.91	■■■■■ 4.14
CKB-208	ENST00000554426	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		40.91	■■■■■ 4.14
CKB-208	ENST00000554426	TBX22	Q9Y458	520 aa		40.89	■■■■■ 4.14
CKB-208	ENST00000554426	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	40.85	■■■■■ 4.13
CKB-208	ENST00000554426	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		40.84	■■■■■ 4.13
CKB-208	ENST00000554426	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	40.84	■■■■■ 4.13
CKB-208	ENST00000554426	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	40.82	■■■■■ 4.13
CKB-208	ENST00000554426	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		40.82	■■■■■ 4.12
CKB-208	ENST00000554426	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	40.81	■■■■■ 4.12
CKB-208	ENST00000554426	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	40.8	■■■■■ 4.12
CKB-208	ENST00000554426	LRP6	O75581	1613 aa		40.79	■■■■■ 4.12
CKB-208	ENST00000554426	UNC13B	O14795	1591 aa		40.78	■■■■■ 4.12
CKB-208	ENST00000554426	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	40.78	■■■■■ 4.12
CKB-208	ENST00000554426	C14orf37	Q86TY3	774 aa		40.75	■■■■■ 4.11
CKB-208	ENST00000554426		E9PCH4	1651 aa		40.72	■■■■■ 4.11
CKB-208	ENST00000554426	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		40.7	■■■■■ 4.11
CKB-208	ENST00000554426	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	40.7	■■■■■ 4.11
CKB-208	ENST00000554426	DIP2A	Q14689	1571 aa		40.69	■■■■■ 4.11
CKB-208	ENST00000554426	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		40.69	■■■■■ 4.11
CKB-208	ENST00000554426	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		40.69	■■■■■ 4.1
CKB-208	ENST00000554426	PIK3R4	Q99570	1358 aa		40.69	■■■■■ 4.1
CKB-208	ENST00000554426	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	40.68	■■■■■ 4.1
CKB-208	ENST00000554426	PTPRU	Q92729	1446 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CKB-208	ENST00000554426	ATF3	P18847	181 aa		40.65	■■■■■ 4.1
CKB-208	ENST00000554426	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		40.62	■■■■■ 4.09
CKB-208	ENST00000554426	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CKB-208	ENST00000554426	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
CKB-208	ENST00000554426	ROCK1	Q13464	1354 aa		40.61	■■■■■ 4.09
CKB-208	ENST00000554426	BRINP3	Q76B58	766 aa		40.59	■■■■■ 4.09
CKB-208	ENST00000554426	TRPM2	O94759	1503 aa		40.58	■■■■■ 4.09
CKB-208	ENST00000554426	SHPRH	Q149N8	1683 aa		40.57	■■■■■ 4.09
CKB-208	ENST00000554426	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	40.57	■■■■■ 4.09
CKB-208	ENST00000554426	NUP155	O75694	1391 aa		40.55	■■■■■ 4.08
CKB-208	ENST00000554426	TRIM52	Q96A61	297 aa		40.54	■■■■■ 4.08
CKB-208	ENST00000554426	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	40.52	■■■■■ 4.08
CKB-208	ENST00000554426	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		40.49	■■■■■ 4.07
CKB-208	ENST00000554426	DCC	P43146	1447 aa		40.48	■■■■■ 4.07
CKB-208	ENST00000554426	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
CKB-208	ENST00000554426	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
CKB-208	ENST00000554426	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	40.46	■■■■■ 4.07
CKB-208	ENST00000554426	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
CKB-208	ENST00000554426	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		40.46	■■■■■ 4.07
CKB-208	ENST00000554426	MST1R	Q04912	1400 aa		40.43	■■■■■ 4.06
CKB-208	ENST00000554426	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		40.43	■■■■■ 4.06
CKB-208	ENST00000554426	MET	P08581	1390 aa		40.41	■■■■■ 4.06
CKB-208	ENST00000554426	RXRB	P28702	533 aa		40.41	■■■■■ 4.06
CKB-208	ENST00000554426	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		40.41	■■■■■ 4.06
CKB-208	ENST00000554426	ITGAE	P38570	1179 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CKB-208	ENST00000554426	AFF2	P51816	1311 aa		40.36	■■■■■ 4.05
CKB-208	ENST00000554426	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	40.33	■■■■■ 4.05
CKB-208	ENST00000554426	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	40.32	■■■■■ 4.05
CKB-208	ENST00000554426	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		40.32	■■■■■ 4.05
CKB-208	ENST00000554426	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	40.32	■■■■■ 4.05
CKB-208	ENST00000554426	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		40.3	■■■■■ 4.04
CKB-208	ENST00000554426	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		40.29	■■■■■ 4.04
CKB-208	ENST00000554426	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	40.27	■■■■■ 4.04
CKB-208	ENST00000554426	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		40.25	■■■■■ 4.03
CKB-208	ENST00000554426	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		40.22	■■■■■ 4.03
CKB-208	ENST00000554426	C8orf37	Q96NL8	207 aa		40.21	■■■■■ 4.03
CKB-208	ENST00000554426	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		40.2	■■■■■ 4.03
CKB-208	ENST00000554426	CLTCL1	P53675	1640 aa		40.2	■■■■■ 4.03
CKB-208	ENST00000554426	RGS12	O14924	1447 aa		40.18	■■■■■ 4.02
CKB-208	ENST00000554426	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	40.18	■■■■■ 4.02
CKB-208	ENST00000554426	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	40.16	■■■■■ 4.02
CKB-208	ENST00000554426	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		40.14	■■■■■ 4.02
CKB-208	ENST00000554426	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	40.12	■■■■■ 4.01
CKB-208	ENST00000554426	ADAMTS2	O95450	1211 aa		40.08	■■■■■ 4.01
CKB-208	ENST00000554426	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		40.08	■■■■■ 4.01
CKB-208	ENST00000554426	ORAI2	Q96SN7	254 aa		40.06	■■■■■ 4
CKB-208	ENST00000554426	PTCH1	Q13635	1447 aa		40.06	■■■■■ 4
CKB-208	ENST00000554426	LAMC1	P11047	1609 aa		40.04	■■■■■ 4
CKB-208	ENST00000554426	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	40.03	■■■■■ 4
CKB-208	ENST00000554426	NGLY1	Q96IV0	654 aa		40.03	■■■■■ 4
CKB-208	ENST00000554426	NAIP	Q13075	1403 aa		39.98	■■■■□ 3.99
CKB-208	ENST00000554426	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		39.97	■■■■□ 3.99
CKB-208	ENST00000554426	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		39.97	■■■■□ 3.99
CKB-208	ENST00000554426	KIF1B	O60333	1816 aa		39.95	■■■■□ 3.99
CKB-208	ENST00000554426	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	39.95	■■■■□ 3.99
CKB-208	ENST00000554426	USP21	Q9UK80	565 aa		39.91	■■■■□ 3.98
CKB-208	ENST00000554426	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	39.89	■■■■□ 3.98
CKB-208	ENST00000554426	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	39.86	■■■■□ 3.97
CKB-208	ENST00000554426	HFM1	A2PYH4	1435 aa		39.85	■■■■□ 3.97
CKB-208	ENST00000554426	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	39.85	■■■■□ 3.97
CKB-208	ENST00000554426	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		39.85	■■■■□ 3.97
CKB-208	ENST00000554426	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		39.84	■■■■□ 3.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms