RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 ZFYVE9O95405 1425 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-229ENST00000551936 ILDR2Q71H61 639 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-229ENST00000551936 KCNA6P17658 529 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-229ENST00000551936 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-229ENST00000551936 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CS-229ENST00000551936 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CS-229ENST00000551936 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-229ENST00000551936 BCANQ96GW7 911 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-229ENST00000551936 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CS-229ENST00000551936 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CS-229ENST00000551936 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
CS-229ENST00000551936 TMEM94Q12767 1356 aa21.99■■□□□ 1.11
CS-229ENST00000551936 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CS-229ENST00000551936 NAIPQ13075 1403 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-229ENST00000551936 NWD1Q149M9 1564 aa21.97■■□□□ 1.11
CS-229ENST00000551936 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CS-229ENST00000551936 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CS-229ENST00000551936 TBX22Q9Y458 520 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-229ENST00000551936 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CS-229ENST00000551936 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CS-229ENST00000551936 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.93■■□□□ 1.1
CS-229ENST00000551936 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.92■■□□□ 1.1
CS-229ENST00000551936 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
CS-229ENST00000551936 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-229ENST00000551936 SOCS7O14512 581 aa21.88■■□□□ 1.09
CS-229ENST00000551936 HFM1A2PYH4 1435 aa21.88■■□□□ 1.09
CS-229ENST00000551936 DIP2AQ14689 1571 aa21.87■■□□□ 1.09
CS-229ENST00000551936 PIK3R4Q99570 1358 aa21.86■■□□□ 1.09
CS-229ENST00000551936 TRIM52Q96A61 297 aa21.85■■□□□ 1.09
CS-229ENST00000551936 MSH6P52701 1360 aa21.85■■□□□ 1.09
CS-229ENST00000551936 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
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CS-229ENST00000551936 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.83■■□□□ 1.09
CS-229ENST00000551936 TRPM2O94759 1503 aa21.83■■□□□ 1.09
CS-229ENST00000551936 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.82■■□□□ 1.08
CS-229ENST00000551936 PTPRUQ92729 1446 aa21.81■■□□□ 1.08
CS-229ENST00000551936 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-229ENST00000551936 SLAIN2Q9P270 581 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-229ENST00000551936 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-229ENST00000551936 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-229ENST00000551936 KIF1BO60333 1816 aa21.78■■□□□ 1.08
CS-229ENST00000551936 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
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CS-229ENST00000551936 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.75■■□□□ 1.07
CS-229ENST00000551936 C14orf37Q86TY3 774 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-229ENST00000551936 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CS-229ENST00000551936 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CS-229ENST00000551936 METP08581 1390 aa21.74■■□□□ 1.07
CS-229ENST00000551936 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
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CS-229ENST00000551936 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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CS-229ENST00000551936 PHLPP1O60346 1717 aa21.69■■□□□ 1.06
CS-229ENST00000551936 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.68■■□□□ 1.06
CS-229ENST00000551936 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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CS-229ENST00000551936 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
CS-229ENST00000551936 BRINP3Q76B58 766 aa21.6■■□□□ 1.05
CS-229ENST00000551936 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.59■■□□□ 1.05
CS-229ENST00000551936 MST1RQ04912 1400 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-229ENST00000551936 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.58■■□□□ 1.05
CS-229ENST00000551936 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-229ENST00000551936 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
CS-229ENST00000551936 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-229ENST00000551936 RGL3Q3MIN7 710 aa21.56■■□□□ 1.04
CS-229ENST00000551936 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-229ENST00000551936 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-229ENST00000551936 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-229ENST00000551936 PTCH1Q13635 1447 aa21.55■■□□□ 1.04
CS-229ENST00000551936 POTEAQ6S8J7 498 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-229ENST00000551936 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-229ENST00000551936 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.53■■□□□ 1.04
CS-229ENST00000551936 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.52■■□□□ 1.03
CS-229ENST00000551936 IFT172Q9UG01 1749 aa21.52■■□□□ 1.03
CS-229ENST00000551936 SHPRHQ149N8 1683 aa21.5■■□□□ 1.03
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CS-229ENST00000551936 LRP6O75581 1613 aa21.49■■□□□ 1.03
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CS-229ENST00000551936 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.48■■□□□ 1.03
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CS-229ENST00000551936 ORAI2Q96SN7 254 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-229ENST00000551936 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CS-229ENST00000551936 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CS-229ENST00000551936 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-229ENST00000551936 STK26Q9P289 416 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-229ENST00000551936 TECPR2O15040 1411 aa21.41■■□□□ 1.02
CS-229ENST00000551936 ABCC11Q96J66 1382 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-229ENST00000551936 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CS-229ENST00000551936 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
CS-229ENST00000551936 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.4■■□□□ 1.02
CS-229ENST00000551936 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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