RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547220.5

DUXAP9-201, Transcript of double homeobox A pseudogene 9, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene DUXAP9, Length 665 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUXAP9-201ENST00000547220 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.57■□□□□ 0.88
DUXAP9-201ENST00000547220 TOM1O60784 492 aa20.55■□□□□ 0.88
DUXAP9-201ENST00000547220 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
DUXAP9-201ENST00000547220 BCANQ96GW7 911 aa20.54■□□□□ 0.88
DUXAP9-201ENST00000547220 HFM1A2PYH4 1435 aa20.53■□□□□ 0.88
DUXAP9-201ENST00000547220 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
DUXAP9-201ENST00000547220 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.51■□□□□ 0.87
DUXAP9-201ENST00000547220 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.5■□□□□ 0.87
DUXAP9-201ENST00000547220 HSPA1LP34931 641 aa20.5■□□□□ 0.87
DUXAP9-201ENST00000547220 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
DUXAP9-201ENST00000547220 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
DUXAP9-201ENST00000547220 KCNA6P17658 529 aa20.48■□□□□ 0.87
DUXAP9-201ENST00000547220 TRIM52Q96A61 297 aa20.48■□□□□ 0.87
DUXAP9-201ENST00000547220 TMEM94Q12767 1356 aa20.47■□□□□ 0.87
DUXAP9-201ENST00000547220 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.47■□□□□ 0.87
DUXAP9-201ENST00000547220 NWD1Q149M9 1564 aa20.46■□□□□ 0.87
DUXAP9-201ENST00000547220 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
DUXAP9-201ENST00000547220 CLTCL1P53675 1640 aa20.45■□□□□ 0.87
DUXAP9-201ENST00000547220 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
DUXAP9-201ENST00000547220 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
DUXAP9-201ENST00000547220 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.44■□□□□ 0.86
DUXAP9-201ENST00000547220 TRPM2O94759 1503 aa20.43■□□□□ 0.86
DUXAP9-201ENST00000547220 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
DUXAP9-201ENST00000547220 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
DUXAP9-201ENST00000547220 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
DUXAP9-201ENST00000547220 TBX22Q9Y458 520 aa20.4■□□□□ 0.86
DUXAP9-201ENST00000547220 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
DUXAP9-201ENST00000547220 FOXD1Q16676 465 aa20.38■□□□□ 0.85
DUXAP9-201ENST00000547220 DIP2AQ14689 1571 aa20.38■□□□□ 0.85
DUXAP9-201ENST00000547220 ILDR2Q71H61 639 aa20.37■□□□□ 0.85
DUXAP9-201ENST00000547220 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.36■□□□□ 0.85
DUXAP9-201ENST00000547220 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.35■□□□□ 0.85
DUXAP9-201ENST00000547220 PTPRUQ92729 1446 aa20.35■□□□□ 0.85
DUXAP9-201ENST00000547220 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.34■□□□□ 0.85
DUXAP9-201ENST00000547220 MSH6P52701 1360 aa20.32■□□□□ 0.84
DUXAP9-201ENST00000547220 KIF1BO60333 1816 aa20.31■□□□□ 0.84
DUXAP9-201ENST00000547220 PIK3R4Q99570 1358 aa20.31■□□□□ 0.84
DUXAP9-201ENST00000547220 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
DUXAP9-201ENST00000547220 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.3■□□□□ 0.84
DUXAP9-201ENST00000547220 METP08581 1390 aa20.3■□□□□ 0.84
DUXAP9-201ENST00000547220 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.29■□□□□ 0.84
DUXAP9-201ENST00000547220 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.29■□□□□ 0.84
DUXAP9-201ENST00000547220 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.28■□□□□ 0.84
DUXAP9-201ENST00000547220 C14orf37Q86TY3 774 aa20.27■□□□□ 0.84
DUXAP9-201ENST00000547220 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.27■□□□□ 0.83
DUXAP9-201ENST00000547220 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
DUXAP9-201ENST00000547220 SLAIN2Q9P270 581 aa20.24■□□□□ 0.83
DUXAP9-201ENST00000547220 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.24■□□□□ 0.83
DUXAP9-201ENST00000547220 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.22■□□□□ 0.83
DUXAP9-201ENST00000547220 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
DUXAP9-201ENST00000547220 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.22■□□□□ 0.83
DUXAP9-201ENST00000547220 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
DUXAP9-201ENST00000547220 C19orf44Q9H6X5 657 aa20.2■□□□□ 0.82
DUXAP9-201ENST00000547220 PPLO60437 1756 aa20.2■□□□□ 0.82
DUXAP9-201ENST00000547220 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
DUXAP9-201ENST00000547220 RGL3Q3MIN7 710 aa20.19■□□□□ 0.82
DUXAP9-201ENST00000547220 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.19■□□□□ 0.82
DUXAP9-201ENST00000547220 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.19■□□□□ 0.82
DUXAP9-201ENST00000547220 ATF3P18847 181 aa20.17■□□□□ 0.82
DUXAP9-201ENST00000547220 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.16■□□□□ 0.82
DUXAP9-201ENST00000547220 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.16■□□□□ 0.82
DUXAP9-201ENST00000547220 PHLPP1O60346 1717 aa20.14■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 ROBO2Q9HCK4 1378 aa20.13■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.13■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 DCCP43146 1447 aa20.12■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.12■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 IFT172Q9UG01 1749 aa20.11■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 MST1RQ04912 1400 aa20.1■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 PTCH1Q13635 1447 aa20.1■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 SOCS7O14512 581 aa20.1■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 BRINP3Q76B58 766 aa20.1■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.08■□□□□ 0.81
DUXAP9-201ENST00000547220 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
DUXAP9-201ENST00000547220 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.07■□□□□ 0.8
DUXAP9-201ENST00000547220 PIK3C2GO75747 1445 aa20.06■□□□□ 0.8
DUXAP9-201ENST00000547220 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.06■□□□□ 0.8
DUXAP9-201ENST00000547220 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
DUXAP9-201ENST00000547220 JCADQ9P266 1359 aa20.06■□□□□ 0.8
DUXAP9-201ENST00000547220 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.04■□□□□ 0.8
DUXAP9-201ENST00000547220 STK26Q9P289 416 aa20.04■□□□□ 0.8
DUXAP9-201ENST00000547220 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
DUXAP9-201ENST00000547220 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 LRP6O75581 1613 aa20■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 NRXN1Q9ULB1 1477 aa19.99■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.99■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 MYOM2P54296 1465 aa19.99■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 NHSL1Q5SYE7 1610 aa19.98■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.98■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 TECPR2O15040 1411 aa19.98■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 HRCP23327 699 aa19.97■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 CFAP70Q5T0N1 1121 aa19.97■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 ORAI2Q96SN7 254 aa19.97■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 SHPRHQ149N8 1683 aa19.96■□□□□ 0.79
DUXAP9-201ENST00000547220 ABCC11Q96J66 1382 aa19.95■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms