RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 KCNA6P17658 529 aa28.72■■■□□ 2.19
LTBR-211ENST00000543190 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
LTBR-211ENST00000543190 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.68■■■□□ 2.18
LTBR-211ENST00000543190 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
LTBR-211ENST00000543190 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.66■■■□□ 2.18
LTBR-211ENST00000543190 TMEM94Q12767 1356 aa28.63■■■□□ 2.17
LTBR-211ENST00000543190 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.62■■■□□ 2.17
LTBR-211ENST00000543190 DIP2AQ14689 1571 aa28.61■■■□□ 2.17
LTBR-211ENST00000543190 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.6■■■□□ 2.17
LTBR-211ENST00000543190 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
LTBR-211ENST00000543190 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
LTBR-211ENST00000543190 NUP155O75694 1391 aa28.58■■■□□ 2.17
LTBR-211ENST00000543190 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.58■■■□□ 2.17
LTBR-211ENST00000543190 TBX22Q9Y458 520 aa28.57■■■□□ 2.16
LTBR-211ENST00000543190 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.55■■■□□ 2.16
LTBR-211ENST00000543190 PIK3R4Q99570 1358 aa28.55■■■□□ 2.16
LTBR-211ENST00000543190 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
LTBR-211ENST00000543190 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.52■■■□□ 2.16
LTBR-211ENST00000543190 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.51■■■□□ 2.16
LTBR-211ENST00000543190 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
LTBR-211ENST00000543190 MSH6P52701 1360 aa28.47■■■□□ 2.15
LTBR-211ENST00000543190 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.44■■■□□ 2.14
LTBR-211ENST00000543190 NAIPQ13075 1403 aa28.43■■■□□ 2.14
LTBR-211ENST00000543190 TRPM2O94759 1503 aa28.43■■■□□ 2.14
LTBR-211ENST00000543190 BCANQ96GW7 911 aa28.42■■■□□ 2.14
LTBR-211ENST00000543190 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.42■■■□□ 2.14
LTBR-211ENST00000543190 ITGAEP38570 1179 aa28.4■■■□□ 2.14
LTBR-211ENST00000543190 SLAIN2Q9P270 581 aa28.38■■■□□ 2.13
LTBR-211ENST00000543190 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
LTBR-211ENST00000543190 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
LTBR-211ENST00000543190 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
LTBR-211ENST00000543190 HFM1A2PYH4 1435 aa28.36■■■□□ 2.13
LTBR-211ENST00000543190 KIF1BO60333 1816 aa28.36■■■□□ 2.13
LTBR-211ENST00000543190 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
LTBR-211ENST00000543190 CLTCL1P53675 1640 aa28.35■■■□□ 2.13
LTBR-211ENST00000543190 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
LTBR-211ENST00000543190 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
LTBR-211ENST00000543190 PHLPP1O60346 1717 aa28.33■■■□□ 2.13
LTBR-211ENST00000543190 DCCP43146 1447 aa28.33■■■□□ 2.13
LTBR-211ENST00000543190 C19orf44Q9H6X5 657 aa28.32■■■□□ 2.12
LTBR-211ENST00000543190 PTPRUQ92729 1446 aa28.32■■■□□ 2.12
LTBR-211ENST00000543190 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.32■■■□□ 2.12
LTBR-211ENST00000543190 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
LTBR-211ENST00000543190 CADPS2Q86UW7 1296 aa28.29■■■□□ 2.12
LTBR-211ENST00000543190 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
LTBR-211ENST00000543190 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
LTBR-211ENST00000543190 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
LTBR-211ENST00000543190 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.26■■■□□ 2.11
LTBR-211ENST00000543190 JCADQ9P266 1359 aa28.24■■■□□ 2.11
LTBR-211ENST00000543190 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
LTBR-211ENST00000543190 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.22■■■□□ 2.11
LTBR-211ENST00000543190 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
LTBR-211ENST00000543190 SHPRHQ149N8 1683 aa28.19■■■□□ 2.1
LTBR-211ENST00000543190 ATF3P18847 181 aa28.19■■■□□ 2.1
LTBR-211ENST00000543190 METP08581 1390 aa28.19■■■□□ 2.1
LTBR-211ENST00000543190 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
LTBR-211ENST00000543190 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.17■■■□□ 2.1
LTBR-211ENST00000543190 PPLO60437 1756 aa28.16■■■□□ 2.1
LTBR-211ENST00000543190 C14orf37Q86TY3 774 aa28.15■■■□□ 2.1
LTBR-211ENST00000543190 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.14■■■□□ 2.1
LTBR-211ENST00000543190 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.14■■■□□ 2.09
LTBR-211ENST00000543190 PTCH1Q13635 1447 aa28.13■■■□□ 2.09
LTBR-211ENST00000543190 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
LTBR-211ENST00000543190 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.13■■■□□ 2.09
LTBR-211ENST00000543190 MST1RQ04912 1400 aa28.12■■■□□ 2.09
LTBR-211ENST00000543190 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.12■■■□□ 2.09
LTBR-211ENST00000543190 BRINP3Q76B58 766 aa28.1■■■□□ 2.09
LTBR-211ENST00000543190 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.09■■■□□ 2.09
LTBR-211ENST00000543190 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
LTBR-211ENST00000543190 LAMC1P11047 1609 aa28.08■■■□□ 2.09
LTBR-211ENST00000543190 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
LTBR-211ENST00000543190 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.07■■■□□ 2.08
LTBR-211ENST00000543190 POTEAQ6S8J7 498 aa28.06■■■□□ 2.08
LTBR-211ENST00000543190 TRIM52Q96A61 297 aa28.06■■■□□ 2.08
LTBR-211ENST00000543190 LRP6O75581 1613 aa28.04■■■□□ 2.08
LTBR-211ENST00000543190 IFT172Q9UG01 1749 aa28.03■■■□□ 2.08
LTBR-211ENST00000543190 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28■■■□□ 2.07
LTBR-211ENST00000543190 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.97■■■□□ 2.07
LTBR-211ENST00000543190 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.97■■■□□ 2.07
LTBR-211ENST00000543190 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.95■■■□□ 2.06
LTBR-211ENST00000543190 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa27.94■■■□□ 2.06
LTBR-211ENST00000543190 TECPR2O15040 1411 aa27.93■■■□□ 2.06
LTBR-211ENST00000543190 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
LTBR-211ENST00000543190 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
LTBR-211ENST00000543190 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.91■■■□□ 2.06
LTBR-211ENST00000543190 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.9■■■□□ 2.06
LTBR-211ENST00000543190 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.9■■■□□ 2.06
LTBR-211ENST00000543190 PIK3C2GO75747 1445 aa27.86■■■□□ 2.05
LTBR-211ENST00000543190 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
LTBR-211ENST00000543190 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.86■■■□□ 2.05
LTBR-211ENST00000543190 FOXD1Q16676 465 aa27.85■■■□□ 2.05
LTBR-211ENST00000543190 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
LTBR-211ENST00000543190 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.84■■■□□ 2.05
LTBR-211ENST00000543190 ABCC11Q96J66 1382 aa27.84■■■□□ 2.05
LTBR-211ENST00000543190 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
LTBR-211ENST00000543190 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
LTBR-211ENST00000543190 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.82■■■□□ 2.04
LTBR-211ENST00000543190 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
LTBR-211ENST00000543190 MYOM2P54296 1465 aa27.77■■■□□ 2.04
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