RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516914.2

RNU6-677P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 677, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-677P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-677P-201ENST00000516914 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
RNU6-677P-201ENST00000516914 SULF1Q8IWU6 871 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 TK2O00142 265 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC10A3P09131 477 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.43□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 NBPF3Q9H094 633 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPTLC1O15269 473 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 HRO43593 1189 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 GCGRP47871 477 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 RDH13Q8NBN7 331 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 GJA5P36382 358 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-677P-201ENST00000516914 KDM4AO75164 1064 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 FLIIQ13045 1269 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 HOXA2O43364 376 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 NDUFV2P19404 249 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 USP46P62068 366 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 MCM6Q14566 821 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLF2Q8IX21 1173 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 RFC5P40937 340 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 LILRB3O75022 631 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 CFHP08603 1231 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 QPCTQ16769 361 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 HLA-CQ95604 372 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.36□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZMYND15Q9H091 742 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC4A3P48751 1232 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 GUCA2AQ02747 115 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 FUT2Q10981 343 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 LRCH3Q96II8 777 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-677P-201ENST00000516914 RNF40O75150 1001 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 FDX1P10109 184 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 BANK1Q8NDB2 785 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 HRCP23327 699 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 SOCS7O14512 581 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 NECTIN2Q92692 538 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 SNRKQ9NRH2 765 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 A6NJR5 290 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATP6V1AP38606 617 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 BCAMP50895 628 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 MORN1Q5T089 497 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.3□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 POM121Q96HA1 1249 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 APLP1P51693 650 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 MTMR2Q13614 643 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 WNT2BQ93097 391 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-677P-201ENST00000516914 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-677P-201ENST00000516914 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms