RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.7■■■■□ 3.15
TRDMT1-211ENST00000495022 ZFYVE9O95405 1425 aa34.7■■■■□ 3.14
TRDMT1-211ENST00000495022 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM94Q12767 1356 aa34.68■■■■□ 3.14
TRDMT1-211ENST00000495022 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.63■■■■□ 3.13
TRDMT1-211ENST00000495022 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.63■■■■□ 3.13
TRDMT1-211ENST00000495022 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.61■■■■□ 3.13
TRDMT1-211ENST00000495022 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
TRDMT1-211ENST00000495022 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
TRDMT1-211ENST00000495022 BCANQ96GW7 911 aa34.6■■■■□ 3.13
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
TRDMT1-211ENST00000495022 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP34.56■■■■□ 3.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa34.55■■■■□ 3.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.54■■■■□ 3.12
TRDMT1-211ENST00000495022 NUP155O75694 1391 aa34.54■■■■□ 3.12
TRDMT1-211ENST00000495022 DIP2AQ14689 1571 aa34.51■■■■□ 3.11
TRDMT1-211ENST00000495022 ITGAEP38570 1179 aa34.5■■■■□ 3.11
TRDMT1-211ENST00000495022 CHGAP10645 457 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
TRDMT1-211ENST00000495022 MSH6P52701 1360 aa34.49■■■■□ 3.11
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
TRDMT1-211ENST00000495022 TBX22Q9Y458 520 aa34.49■■■■□ 3.11
TRDMT1-211ENST00000495022 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.48■■■■□ 3.11
TRDMT1-211ENST00000495022 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.11
TRDMT1-211ENST00000495022 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.44■■■■□ 3.1
TRDMT1-211ENST00000495022 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa34.41■■■■□ 3.1
TRDMT1-211ENST00000495022 PIK3R4Q99570 1358 aa34.41■■■■□ 3.1
TRDMT1-211ENST00000495022 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
TRDMT1-211ENST00000495022 TRPM2O94759 1503 aa34.37■■■■□ 3.09
TRDMT1-211ENST00000495022 PHLPP1O60346 1717 aa34.36■■■■□ 3.09
TRDMT1-211ENST00000495022 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
TRDMT1-211ENST00000495022 SLAIN2Q9P270 581 aa34.36■■■■□ 3.09
TRDMT1-211ENST00000495022 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.09
TRDMT1-211ENST00000495022 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.3■■■■□ 3.08
TRDMT1-211ENST00000495022 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.3■■■■□ 3.08
TRDMT1-211ENST00000495022 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF1BO60333 1816 aa34.26■■■■□ 3.08
TRDMT1-211ENST00000495022 NAIPQ13075 1403 aa34.26■■■■□ 3.07
TRDMT1-211ENST00000495022 C14orf37Q86TY3 774 aa34.25■■■■□ 3.07
TRDMT1-211ENST00000495022 CLTCL1P53675 1640 aa34.25■■■■□ 3.07
TRDMT1-211ENST00000495022 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPRUQ92729 1446 aa34.24■■■■□ 3.07
TRDMT1-211ENST00000495022 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
TRDMT1-211ENST00000495022 C19orf44Q9H6X5 657 aa34.23■■■■□ 3.07
TRDMT1-211ENST00000495022 CADPS2Q86UW7 1296 aa34.22■■■■□ 3.07
TRDMT1-211ENST00000495022 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.22■■■■□ 3.07
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
TRDMT1-211ENST00000495022 JCADQ9P266 1359 aa34.2■■■■□ 3.06
TRDMT1-211ENST00000495022 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa34.18■■■■□ 3.06
TRDMT1-211ENST00000495022 ATF3P18847 181 aa34.18■■■■□ 3.06
TRDMT1-211ENST00000495022 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
TRDMT1-211ENST00000495022 DCCP43146 1447 aa34.16■■■■□ 3.06
TRDMT1-211ENST00000495022 HFM1A2PYH4 1435 aa34.13■■■■□ 3.05
TRDMT1-211ENST00000495022 SHPRHQ149N8 1683 aa34.1■■■■□ 3.05
TRDMT1-211ENST00000495022 METP08581 1390 aa34.09■■■■□ 3.05
TRDMT1-211ENST00000495022 POTEAQ6S8J7 498 aa34.08■■■■□ 3.05
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.04■■■■□ 3.04
TRDMT1-211ENST00000495022 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
TRDMT1-211ENST00000495022 BRINP3Q76B58 766 aa34.02■■■■□ 3.04
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM52Q96A61 297 aa34.02■■■■□ 3.04
TRDMT1-211ENST00000495022 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.02■■■■□ 3.04
TRDMT1-211ENST00000495022 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34■■■■□ 3.03
TRDMT1-211ENST00000495022 MST1RQ04912 1400 aa34■■■■□ 3.03
TRDMT1-211ENST00000495022 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa34■■■■□ 3.03
TRDMT1-211ENST00000495022 NHSL1Q5SYE7 1610 aa34■■■■□ 3.03
TRDMT1-211ENST00000495022 PPLO60437 1756 aa33.99■■■■□ 3.03
TRDMT1-211ENST00000495022 LRP6O75581 1613 aa33.98■■■■□ 3.03
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
TRDMT1-211ENST00000495022 VGFO15240 615 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
TRDMT1-211ENST00000495022 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa33.93■■■■□ 3.02
TRDMT1-211ENST00000495022 PTCH1Q13635 1447 aa33.93■■■■□ 3.02
TRDMT1-211ENST00000495022 SETD5Q9C0A6 1442 aa33.9■■■■□ 3.02
TRDMT1-211ENST00000495022 PRAG1Q86YV5 1406 aa33.89■■■■□ 3.02
TRDMT1-211ENST00000495022 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
TRDMT1-211ENST00000495022 ROBO2Q9HCK4 1378 aa33.82■■■■□ 3
TRDMT1-211ENST00000495022 LAMC1P11047 1609 aa33.82■■■■□ 3
TRDMT1-211ENST00000495022 C1orf167Q5SNV9 1468 aa33.8■■■■□ 3
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP33.8■■■■□ 3
TRDMT1-211ENST00000495022 IFT172Q9UG01 1749 aa33.79■■■■□ 3
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC144AA2RUR9 1427 aa33.78■■■■□ 3
TRDMT1-211ENST00000495022 FOXD1Q16676 465 aa33.76■■■■□ 3
TRDMT1-211ENST00000495022 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
TRDMT1-211ENST00000495022 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
TRDMT1-211ENST00000495022 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
TRDMT1-211ENST00000495022 PNPLA6Q8IY17 1366 aa33.72■■■□□ 2.99
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa33.72■■■□□ 2.99
TRDMT1-211ENST00000495022 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
TRDMT1-211ENST00000495022 MPHOSPH9Q99550 1183 aa33.7■■■□□ 2.98
TRDMT1-211ENST00000495022 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa33.68■■■□□ 2.98
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa33.68■■■□□ 2.98
TRDMT1-211ENST00000495022 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa33.66■■■□□ 2.98
TRDMT1-211ENST00000495022 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
TRDMT1-211ENST00000495022 KNDC1Q76NI1 1749 aa33.65■■■□□ 2.98
TRDMT1-211ENST00000495022 AFF2P51816 1311 aa33.65■■■□□ 2.98
TRDMT1-211ENST00000495022 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
TRDMT1-211ENST00000495022 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
TRDMT1-211ENST00000495022 TECPR2O15040 1411 aa33.63■■■□□ 2.97
TRDMT1-211ENST00000495022 RXRBP28702 533 aa33.63■■■□□ 2.97
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