RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491843.2

ZNF638-222, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 3

Gene ZNF638, Length 332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-222	ENST00000491843	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ZNF638-222	ENST00000491843	MAP2K5	Q13163	448 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ZNF638-222	ENST00000491843	PHOX2B	Q99453	314 aa		11.99	□□□□□ -0.49
ZNF638-222	ENST00000491843	APLP1	P51693	650 aa		11.97	□□□□□ -0.49
ZNF638-222	ENST00000491843	IRF6	O14896	467 aa		11.95	□□□□□ -0.5
ZNF638-222	ENST00000491843	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
ZNF638-222	ENST00000491843	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
ZNF638-222	ENST00000491843	CCDC102A	Q96A19	550 aa		11.92	□□□□□ -0.5
ZNF638-222	ENST00000491843	SLC10A3	P09131	477 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF638-222	ENST00000491843	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
ZNF638-222	ENST00000491843	NECTIN2	Q92692	538 aa		11.91	□□□□□ -0.5
ZNF638-222	ENST00000491843	ZMYND10	O75800	440 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ZNF638-222	ENST00000491843	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ZNF638-222	ENST00000491843	BCAN	Q96GW7	911 aa		11.9	□□□□□ -0.5
ZNF638-222	ENST00000491843	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
ZNF638-222	ENST00000491843	CFH	P08603	1231 aa		11.89	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	KCNC4	Q03721	635 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	MTR	Q99707	1265 aa		11.88	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	COPS2	P61201	443 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		11.87	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	RDH13	Q8NBN7	331 aa		11.86	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	11.85	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	IFFO2	Q5TF58	517 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	ZNF516	Q92618	1163 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	PRR14	Q9BWN1	585 aa		11.84	□□□□□ -0.51
ZNF638-222	ENST00000491843	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ZNF638-222	ENST00000491843	IL21	Q9HBE4	155 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ZNF638-222	ENST00000491843	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.83	□□□□□ -0.52
ZNF638-222	ENST00000491843	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	11.81	□□□□□ -0.52
ZNF638-222	ENST00000491843	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.81	□□□□□ -0.52
ZNF638-222	ENST00000491843		A0A0G2JS52	829 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ZNF638-222	ENST00000491843	SULF1	Q8IWU6	871 aa		11.8	□□□□□ -0.52
ZNF638-222	ENST00000491843	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.78	□□□□□ -0.52
ZNF638-222	ENST00000491843	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	ZPR1	O75312	459 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	CLCN1	P35523	988 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	GCGR	P47871	477 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		11.75	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	FUT2	Q10981	343 aa		11.74	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	CD46	P15529	392 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.73	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	TLL1	O43897	1013 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	AK7	Q96M32	723 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		11.72	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
ZNF638-222	ENST00000491843	TRIM66	O15016	1216 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ZNF638-222	ENST00000491843	AMHR2	Q16671	573 aa		11.7	□□□□□ -0.54
ZNF638-222	ENST00000491843	NR1I2	O75469	434 aa		11.69	□□□□□ -0.54
ZNF638-222	ENST00000491843	ATP6V1A	P38606	617 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ZNF638-222	ENST00000491843	MORN1	Q5T089	497 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ZNF638-222	ENST00000491843	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ZNF638-222	ENST00000491843	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.68	□□□□□ -0.54
ZNF638-222	ENST00000491843	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ZNF638-222	ENST00000491843	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
ZNF638-222	ENST00000491843	KDM4A	O75164	1064 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF638-222	ENST00000491843	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF638-222	ENST00000491843	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		11.65	□□□□□ -0.54
ZNF638-222	ENST00000491843	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ZNF638-222	ENST00000491843	HLA-C	Q95604	372 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ZNF638-222	ENST00000491843	ADH1B	P00325	375 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF638-222	ENST00000491843	PDE4D	Q08499	809 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF638-222	ENST00000491843	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ZNF638-222	ENST00000491843	S1PR4	O95977	384 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF638-222	ENST00000491843	GGCX	P38435	758 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF638-222	ENST00000491843	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF638-222	ENST00000491843	SPSB2	Q99619	263 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ZNF638-222	ENST00000491843	RGS20	O76081	388 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ZNF638-222	ENST00000491843	PPEF1	O14829	653 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	HOXA2	O43364	376 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	MS4A1	P11836	297 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	THAP11	Q96EK4	314 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	RNF223	E7ERA6	249 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	USP46	P62068	366 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.55	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		11.55	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	11.54	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		11.54	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		11.53	□□□□□ -0.56
ZNF638-222	ENST00000491843		Q3C1V9	767 aa		11.52	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	11.52	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	NDUFV2	P19404	249 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	FDX1	P10109	184 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
ZNF638-222	ENST00000491843	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		11.46	□□□□□ -0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms