RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485176.1

PRKCE-211, Transcript of protein kinase C epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene PRKCE, Length 372 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCE-211ENST00000485176 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 TMUB1Q9BVT8 246 aa5.33□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.33□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 GPCPD1Q9NPB8 672 aa5.33□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 MS4A1P11836 297 aa5.32□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa5.32□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.32□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 ZDHHC16Q969W1 377 aa5.32□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 FLIIQ13045 1269 aa5.31□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 ZNF454Q8N9F8 522 aa5.31□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 ZMYND15Q9H091 742 aa5.31□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 ARHGAP33O14559 1287 aa5.3□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 SH3D19Q5HYK7 790 aa5.3□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 TTC13Q8NBP0 860 aa5.3□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 RSPH6AQ9H0K4 717 aa5.3□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 PADI6Q6TGC4 694 aa5.29□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 THSD4Q6ZMP0 1018 aa5.29□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 ADGRG1Q9Y653 693 aa5.29□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 NUDT7P0C024 238 aa5.28□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 LCE1DQ5T752 114 aa5.28□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 HOMEZQ8IX15 550 aa5.28□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 PXYLP1Q8TE99 480 aa5.28□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 PHOX2BQ99453 314 aa5.28□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.28□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.28□□□□□ -1.56
PRKCE-211ENST00000485176 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 PRSS12P56730 875 aa5.27□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa5.27□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP5.27□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 ADAM33Q9BZ11 813 aa5.27□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 DIXDC1Q155Q3 683 aa5.26□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 CDCA7LQ96GN5 454 aa5.26□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 BEGAINQ9BUH8 593 aa5.26□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 BCL2L12Q9HB09 334 aa5.25□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa5.24□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 MYT1Q01538 1121 aa5.24□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 PRKD2Q9BZL6 878 aa5.24□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 LHX6Q9UPM6 363 aa5.24□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 PTPREP23469 700 aa5.23□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 FAM161AQ3B820 660 aa5.23□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.23□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 SULF1Q8IWU6 871 aa5.22□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 EYA1Q99502 592 aa5.22□□□□□ -1.57
PRKCE-211ENST00000485176 A6NJR5 290 aa5.21□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 NBPF26B4DH59 902 aa5.21□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 COL9A1P20849 921 aa5.21□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 CLK2P49760 499 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 MYSM1Q5VVJ2 828 aa5.21□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 DMRTA1Q5VZB9 504 aa5.21□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 RCCD1A6NED2 376 aa5.2□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa5.2□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 CD46P15529 392 aa5.2□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 DNAJB2P25686 324 aa5.2□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 MCM6Q14566 821 aa5.2□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 TUSC1Q2TAM9 212 aa5.2□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 PACS2Q86VP3 889 aa5.2□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 NLRP7Q8WX94 980 aa5.2□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 KCNH8Q96L42 1107 aa5.2□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 TBC1D2Q9BYX2 928 aa5.2□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 FAM198AQ9UFP1 575 aa5.2□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 UBTFP17480 764 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 LCE2CQ5TA81 110 aa5.19□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 BANK1Q8NDB2 785 aa5.19□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 POLR3EQ9NVU0 708 aa5.19□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 TSKSQ9UJT2 592 aa5.19□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 SPDYE5A6NIY4 337 aa5.18□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 GJA5P36382 358 aa5.18□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 PPP2R2DQ66LE6 453 aa5.18□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 NUDT18Q6ZVK8 323 aa5.18□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 SPIRE2Q8WWL2 714 aa5.18□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 TATDN2Q93075 761 aa5.18□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 TMEM134Q9H6X4 195 aa5.18□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 PNMA3Q9UL41 463 aa5.18□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 V9GY48 417 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 TMEM259Q4ZIN3 620 aa5.17□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 NUTM1Q86Y26 1132 aa5.17□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa5.17□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 SOCS7O14512 581 aa5.16□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 SPTLC1O15269 473 aa5.16□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 RAD21O60216 631 aa5.16□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 TRAK2O60296 914 aa5.16□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 RFC5P40937 340 aa5.16□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 KCNC4Q03721 635 aa5.16□□□□□ -1.58
PRKCE-211ENST00000485176 RSPH4AQ5TD94 716 aa5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms