RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 NUP155O75694 1391 aa30.68■■■□□ 2.5
ACTB-212ENST00000484841 KCNA6P17658 529 aa30.68■■■□□ 2.5
ACTB-212ENST00000484841 ALKQ9UM73 1620 aa30.68■■■□□ 2.5
ACTB-212ENST00000484841 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
ACTB-212ENST00000484841 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
ACTB-212ENST00000484841 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa30.65■■■□□ 2.5
ACTB-212ENST00000484841 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
ACTB-212ENST00000484841 RIMS2Q9UQ26 1411 aa30.63■■■□□ 2.49
ACTB-212ENST00000484841 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP30.62■■■□□ 2.493e-11■■■■□ 24.1
ACTB-212ENST00000484841 SOCS7O14512 581 aa30.6■■■□□ 2.49
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa30.6■■■□□ 2.49
ACTB-212ENST00000484841 ZFYVE9O95405 1425 aa30.59■■■□□ 2.49
ACTB-212ENST00000484841 TMEM94Q12767 1356 aa30.59■■■□□ 2.49
ACTB-212ENST00000484841 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
ACTB-212ENST00000484841 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
ACTB-212ENST00000484841 NWD1Q149M9 1564 aa30.54■■■□□ 2.48
ACTB-212ENST00000484841 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP30.53■■■□□ 2.48
ACTB-212ENST00000484841 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
ACTB-212ENST00000484841 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
ACTB-212ENST00000484841 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
ACTB-212ENST00000484841 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.47
ACTB-212ENST00000484841 TBX22Q9Y458 520 aa30.5■■■□□ 2.47
ACTB-212ENST00000484841 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa30.5■■■□□ 2.47
ACTB-212ENST00000484841 MSH6P52701 1360 aa30.49■■■□□ 2.47
ACTB-212ENST00000484841 FAM135BQ49AJ0 1406 aa30.46■■■□□ 2.47
ACTB-212ENST00000484841 DIP2AQ14689 1571 aa30.44■■■□□ 2.46
ACTB-212ENST00000484841 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
ACTB-212ENST00000484841 C14orf37Q86TY3 774 aa30.43■■■□□ 2.46
ACTB-212ENST00000484841 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa30.41■■■□□ 2.46
ACTB-212ENST00000484841 NAIPQ13075 1403 aa30.39■■■□□ 2.46
ACTB-212ENST00000484841 PIK3R4Q99570 1358 aa30.39■■■□□ 2.45
ACTB-212ENST00000484841 TRIM52Q96A61 297 aa30.38■■■□□ 2.45
ACTB-212ENST00000484841 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa30.38■■■□□ 2.45
ACTB-212ENST00000484841 TRPM2O94759 1503 aa30.37■■■□□ 2.45
ACTB-212ENST00000484841 SLAIN2Q9P270 581 aa30.35■■■□□ 2.45
ACTB-212ENST00000484841 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.35■■■□□ 2.45
ACTB-212ENST00000484841 KIF1BO60333 1816 aa30.33■■■□□ 2.45
ACTB-212ENST00000484841 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa30.3■■■□□ 2.44
ACTB-212ENST00000484841 HFM1A2PYH4 1435 aa30.3■■■□□ 2.44
ACTB-212ENST00000484841 CLTCL1P53675 1640 aa30.29■■■□□ 2.44
ACTB-212ENST00000484841 ATF3P18847 181 aa30.29■■■□□ 2.44
ACTB-212ENST00000484841 PHLPP1O60346 1717 aa30.27■■■□□ 2.44
ACTB-212ENST00000484841 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.27■■■□□ 2.44
ACTB-212ENST00000484841 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.27■■■□□ 2.44
ACTB-212ENST00000484841 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa30.26■■■□□ 2.43
ACTB-212ENST00000484841 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
ACTB-212ENST00000484841 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
ACTB-212ENST00000484841 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa30.22■■■□□ 2.43
ACTB-212ENST00000484841 PTPRUQ92729 1446 aa30.2■■■□□ 2.42
ACTB-212ENST00000484841 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa30.19■■■□□ 2.42
ACTB-212ENST00000484841 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
ACTB-212ENST00000484841 VGFO15240 615 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
ACTB-212ENST00000484841 JCADQ9P266 1359 aa30.15■■■□□ 2.42
ACTB-212ENST00000484841 METP08581 1390 aa30.14■■■□□ 2.41
ACTB-212ENST00000484841 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa30.11■■■□□ 2.41
ACTB-212ENST00000484841 DCCP43146 1447 aa30.1■■■□□ 2.41
ACTB-212ENST00000484841 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
ACTB-212ENST00000484841 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
ACTB-212ENST00000484841 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
ACTB-212ENST00000484841 PPLO60437 1756 aa30.04■■■□□ 2.4
ACTB-212ENST00000484841 FOXD1Q16676 465 aa30.03■■■□□ 2.4
ACTB-212ENST00000484841 BRINP3Q76B58 766 aa30.03■■■□□ 2.4
ACTB-212ENST00000484841 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.02■■■□□ 2.4
ACTB-212ENST00000484841 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
ACTB-212ENST00000484841 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.02■■■□□ 2.4
ACTB-212ENST00000484841 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
ACTB-212ENST00000484841 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30■■■□□ 2.39
ACTB-212ENST00000484841 MPHOSPH9Q99550 1183 aa30■■■□□ 2.39
ACTB-212ENST00000484841 NALCNQ8IZF0 1738 aa29.98■■■□□ 2.39
ACTB-212ENST00000484841 MST1RQ04912 1400 aa29.97■■■□□ 2.39
ACTB-212ENST00000484841 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.97■■■□□ 2.39
ACTB-212ENST00000484841 SHPRHQ149N8 1683 aa29.97■■■□□ 2.39
ACTB-212ENST00000484841 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ACTB-212ENST00000484841 POTEAQ6S8J7 498 aa29.96■■■□□ 2.39
ACTB-212ENST00000484841 RGL3Q3MIN7 710 aa29.95■■■□□ 2.39
ACTB-212ENST00000484841 PTCH1Q13635 1447 aa29.94■■■□□ 2.38
ACTB-212ENST00000484841 NHSL1Q5SYE7 1610 aa29.91■■■□□ 2.38
ACTB-212ENST00000484841 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
ACTB-212ENST00000484841 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.88■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa29.88■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 ROBO2Q9HCK4 1378 aa29.88■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 LRP6O75581 1613 aa29.87■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa29.84■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 C1orf167Q5SNV9 1468 aa29.84■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 IFT172Q9UG01 1749 aa29.84■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.83■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.83■■■□□ 2.37
ACTB-212ENST00000484841 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
ACTB-212ENST00000484841 STK26Q9P289 416 aa29.8■■■□□ 2.36
ACTB-212ENST00000484841 ORAI2Q96SN7 254 aa29.75■■■□□ 2.35
ACTB-212ENST00000484841 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.75■■■□□ 2.35
ACTB-212ENST00000484841 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.72■■■□□ 2.35
ACTB-212ENST00000484841 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
ACTB-212ENST00000484841 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.72■■■□□ 2.35
ACTB-212ENST00000484841 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.72■■■□□ 2.35
ACTB-212ENST00000484841 PIK3C2GO75747 1445 aa29.71■■■□□ 2.35
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