RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469059.1

EPC1-205, Transcript of enhancer of polycomb homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene EPC1, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPC1-205ENST00000469059 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
EPC1-205ENST00000469059 TET3O43151 1660 aa25.22■■□□□ 1.63
EPC1-205ENST00000469059 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.21■■□□□ 1.63
EPC1-205ENST00000469059 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
EPC1-205ENST00000469059 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.2■■□□□ 1.63
EPC1-205ENST00000469059 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
EPC1-205ENST00000469059 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
EPC1-205ENST00000469059 MSH6P52701 1360 aa25.18■■□□□ 1.62
EPC1-205ENST00000469059 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
EPC1-205ENST00000469059 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.18■■□□□ 1.62
EPC1-205ENST00000469059 ROCK1Q13464 1354 aa25.17■■□□□ 1.62
EPC1-205ENST00000469059 C14orf37Q86TY3 774 aa25.16■■□□□ 1.62
EPC1-205ENST00000469059 NUP155O75694 1391 aa25.16■■□□□ 1.62
EPC1-205ENST00000469059 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
EPC1-205ENST00000469059 ZFYVE9O95405 1425 aa25.15■■□□□ 1.62
EPC1-205ENST00000469059 SLAIN2Q9P270 581 aa25.14■■□□□ 1.62
EPC1-205ENST00000469059 TBX22Q9Y458 520 aa25.13■■□□□ 1.61
EPC1-205ENST00000469059 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.11■■□□□ 1.61
EPC1-205ENST00000469059 UNC13BO14795 1591 aa25.11■■□□□ 1.61
EPC1-205ENST00000469059 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.1■■□□□ 1.61
EPC1-205ENST00000469059 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.09■■□□□ 1.61
EPC1-205ENST00000469059 NWD1Q149M9 1564 aa25.09■■□□□ 1.61
EPC1-205ENST00000469059 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.07■■□□□ 1.6
EPC1-205ENST00000469059 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
EPC1-205ENST00000469059 E9PCH4 1651 aa25.06■■□□□ 1.6
EPC1-205ENST00000469059 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
EPC1-205ENST00000469059 ATF3P18847 181 aa25.03■■□□□ 1.6
EPC1-205ENST00000469059 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.03■■□□□ 1.6
EPC1-205ENST00000469059 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
EPC1-205ENST00000469059 CADPS2Q86UW7 1296 aa25■■□□□ 1.59
EPC1-205ENST00000469059 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25■■□□□ 1.59
EPC1-205ENST00000469059 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25■■□□□ 1.59
EPC1-205ENST00000469059 PIK3R4Q99570 1358 aa24.99■■□□□ 1.59
EPC1-205ENST00000469059 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.99■■□□□ 1.59
EPC1-205ENST00000469059 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.99■■□□□ 1.59
EPC1-205ENST00000469059 JCADQ9P266 1359 aa24.97■■□□□ 1.59
EPC1-205ENST00000469059 POTEAQ6S8J7 498 aa24.97■■□□□ 1.59
EPC1-205ENST00000469059 DIP2AQ14689 1571 aa24.95■■□□□ 1.58
EPC1-205ENST00000469059 PHLPP1O60346 1717 aa24.94■■□□□ 1.58
EPC1-205ENST00000469059 TRPM2O94759 1503 aa24.92■■□□□ 1.58
EPC1-205ENST00000469059 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
EPC1-205ENST00000469059 TRIM52Q96A61 297 aa24.89■■□□□ 1.58
EPC1-205ENST00000469059 PTPRUQ92729 1446 aa24.88■■□□□ 1.57
EPC1-205ENST00000469059 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
EPC1-205ENST00000469059 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.85■■□□□ 1.57
EPC1-205ENST00000469059 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.84■■□□□ 1.57
EPC1-205ENST00000469059 BRINP3Q76B58 766 aa24.84■■□□□ 1.57
EPC1-205ENST00000469059 METP08581 1390 aa24.81■■□□□ 1.56
EPC1-205ENST00000469059 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
EPC1-205ENST00000469059 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
EPC1-205ENST00000469059 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
EPC1-205ENST00000469059 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
EPC1-205ENST00000469059 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
EPC1-205ENST00000469059 NAIPQ13075 1403 aa24.79■■□□□ 1.56
EPC1-205ENST00000469059 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.79■■□□□ 1.56
EPC1-205ENST00000469059 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
EPC1-205ENST00000469059 DCCP43146 1447 aa24.78■■□□□ 1.56
EPC1-205ENST00000469059 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
EPC1-205ENST00000469059 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
EPC1-205ENST00000469059 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
EPC1-205ENST00000469059 CLTCL1P53675 1640 aa24.75■■□□□ 1.55
EPC1-205ENST00000469059 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.75■■□□□ 1.55
EPC1-205ENST00000469059 LRP6O75581 1613 aa24.73■■□□□ 1.55
EPC1-205ENST00000469059 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
EPC1-205ENST00000469059 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
EPC1-205ENST00000469059 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.71■■□□□ 1.55
EPC1-205ENST00000469059 MST1RQ04912 1400 aa24.71■■□□□ 1.55
EPC1-205ENST00000469059 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
EPC1-205ENST00000469059 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.7■■□□□ 1.54
EPC1-205ENST00000469059 KIF1BO60333 1816 aa24.7■■□□□ 1.54
EPC1-205ENST00000469059 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.69■■□□□ 1.54
EPC1-205ENST00000469059 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.68■■□□□ 1.54
EPC1-205ENST00000469059 HFM1A2PYH4 1435 aa24.68■■□□□ 1.54
EPC1-205ENST00000469059 SHPRHQ149N8 1683 aa24.67■■□□□ 1.54
EPC1-205ENST00000469059 RXRBP28702 533 aa24.67■■□□□ 1.54
EPC1-205ENST00000469059 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.65■■□□□ 1.54
EPC1-205ENST00000469059 FOXD1Q16676 465 aa24.64■■□□□ 1.54
EPC1-205ENST00000469059 AFF2P51816 1311 aa24.63■■□□□ 1.53
EPC1-205ENST00000469059 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
EPC1-205ENST00000469059 C8orf37Q96NL8 207 aa24.62■■□□□ 1.53
EPC1-205ENST00000469059 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.61■■□□□ 1.53
EPC1-205ENST00000469059 RGL3Q3MIN7 710 aa24.6■■□□□ 1.53
EPC1-205ENST00000469059 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.59■■□□□ 1.53
EPC1-205ENST00000469059 ORAI2Q96SN7 254 aa24.59■■□□□ 1.53
EPC1-205ENST00000469059 PTCH1Q13635 1447 aa24.58■■□□□ 1.53
EPC1-205ENST00000469059 PNPLA6Q8IY17 1366 aa24.57■■□□□ 1.52
EPC1-205ENST00000469059 ADAMTS2O95450 1211 aa24.57■■□□□ 1.52
EPC1-205ENST00000469059 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.57■■□□□ 1.52
EPC1-205ENST00000469059 NGLY1Q96IV0 654 aa24.56■■□□□ 1.52
EPC1-205ENST00000469059 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.56■■□□□ 1.52
EPC1-205ENST00000469059 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
EPC1-205ENST00000469059 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
EPC1-205ENST00000469059 STK26Q9P289 416 aa24.55■■□□□ 1.52
EPC1-205ENST00000469059 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.54■■□□□ 1.52
EPC1-205ENST00000469059 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.52■■□□□ 1.52
EPC1-205ENST00000469059 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.52■■□□□ 1.52
EPC1-205ENST00000469059 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.52■■□□□ 1.52
EPC1-205ENST00000469059 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
EPC1-205ENST00000469059 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
EPC1-205ENST00000469059 PPLO60437 1756 aa24.47■■□□□ 1.51
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