RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445540.1

GPC6-AS2-201, GPC6 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC6-AS2, Length 587 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6-AS2-201ENST00000445540 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.48□□□□□ -1.21
GPC6-AS2-201ENST00000445540 CADPS2Q86UW7 1296 aa7.48□□□□□ -1.21
GPC6-AS2-201ENST00000445540 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.48□□□□□ -1.21
GPC6-AS2-201ENST00000445540 PRR14Q9BWN1 585 aa7.46□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 WIPF1O43516 503 aa7.45□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.44□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 DACH1Q9UI36 760 aa7.44□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.43□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 TLL1O43897 1013 aa7.43□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 S1PR4O95977 384 aa7.43□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 PDIA6Q15084 440 aa7.43□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.43□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 FOXC1Q12948 553 aa7.41□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.41□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.4□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 AXIN1O15169 862 aa7.4□□□□□ -1.22
GPC6-AS2-201ENST00000445540 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.39□□□□□ -1.23
GPC6-AS2-201ENST00000445540 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.38□□□□□ -1.23
GPC6-AS2-201ENST00000445540 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.38□□□□□ -1.23
GPC6-AS2-201ENST00000445540 AVPP01185 164 aa7.36□□□□□ -1.23
GPC6-AS2-201ENST00000445540 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.36□□□□□ -1.23
GPC6-AS2-201ENST00000445540 PADI6Q6TGC4 694 aa7.36□□□□□ -1.23
GPC6-AS2-201ENST00000445540 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.35□□□□□ -1.23
GPC6-AS2-201ENST00000445540 ADH1BP00325 375 aa7.35□□□□□ -1.23
GPC6-AS2-201ENST00000445540 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.35□□□□□ -1.23
GPC6-AS2-201ENST00000445540 TTC13Q8NBP0 860 aa7.35□□□□□ -1.23
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.35□□□□□ -1.23
GPC6-AS2-201ENST00000445540 CYP4X1Q8N118 509 aa7.34□□□□□ -1.23
GPC6-AS2-201ENST00000445540 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.33□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 EYA1Q99502 592 aa7.33□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 OSBPP22059 807 aa7.32□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.32□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 NR1I2O75469 434 aa7.31□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 LCE2CQ5TA81 110 aa7.31□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 RPIAP49247 311 aa7.28□□□□□ -1.24
GPC6-AS2-201ENST00000445540 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 CFHP08603 1231 aa7.27□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 DNAJB2P25686 324 aa7.27□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa7.27□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SENP2Q9HC62 589 aa7.26□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.25□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.24□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.24□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 TRIM47Q96LD4 638 aa7.24□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SPSB2Q99619 263 aa7.24□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.24□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 E2F4Q16254 413 aa7.23□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.23□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
GPC6-AS2-201ENST00000445540 KIFC2Q96AC6 838 aa7.21□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 RCCD1A6NED2 376 aa7.19□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SLC10A3P09131 477 aa7.19□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SMPD1P17405 629 aa7.19□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 GMPRP36959 345 aa7.19□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 IRF7Q92985 503 aa7.16□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.16□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 WDR70Q9NW82 654 aa7.15□□□□□ -1.26
GPC6-AS2-201ENST00000445540 J3QL48 77 aa7.14□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 WNT7AO00755 349 aa7.14□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.14□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 HPS1Q92902 700 aa7.13□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 FAM161AQ3B820 660 aa7.12□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.11□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.11□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 VEGFBP49765 207 aa7.1□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 PTGDRQ13258 359 aa7.1□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 THAP11Q96EK4 314 aa7.09□□□□□ -1.27
GPC6-AS2-201ENST00000445540 MORN1Q5T089 497 aa7.08□□□□□ -1.28
GPC6-AS2-201ENST00000445540 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.08□□□□□ -1.28
GPC6-AS2-201ENST00000445540 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.08□□□□□ -1.28
GPC6-AS2-201ENST00000445540 TRIM32Q13049 653 aa7.07□□□□□ -1.28
GPC6-AS2-201ENST00000445540 H3BM21 787 aa7.06□□□□□ -1.28
GPC6-AS2-201ENST00000445540 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
GPC6-AS2-201ENST00000445540 ERBB4Q15303 1308 aa7.05□□□□□ -1.28
GPC6-AS2-201ENST00000445540 FECHP22830 423 aa7.05□□□□□ -1.28
GPC6-AS2-201ENST00000445540 ATP6V1AP38606 617 aa7.05□□□□□ -1.28
GPC6-AS2-201ENST00000445540 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms