RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440428.5

FAM58A-202, Transcript of Cyclin-related protein FAM58A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene FAM58A, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58A-202ENST00000440428 RIMS2Q9UQ26 1411 aa43.9■■■■■ 4.62
FAM58A-202ENST00000440428 HSPA1LP34931 641 aa43.88■■■■■ 4.62
FAM58A-202ENST00000440428 NAIPQ13075 1403 aa43.88■■■■■ 4.61
FAM58A-202ENST00000440428 CHGAP10645 457 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
FAM58A-202ENST00000440428 KCNA6P17658 529 aa43.84■■■■■ 4.61
FAM58A-202ENST00000440428 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa43.83■■■■■ 4.61
FAM58A-202ENST00000440428 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
FAM58A-202ENST00000440428 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa43.79■■■■■ 4.6
FAM58A-202ENST00000440428 BCANQ96GW7 911 aa43.78■■■■■ 4.6
FAM58A-202ENST00000440428 NWD1Q149M9 1564 aa43.78■■■■■ 4.6
FAM58A-202ENST00000440428 HDGFP51858 240 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
FAM58A-202ENST00000440428 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP43.76■■■■■ 4.6
FAM58A-202ENST00000440428 TMEM94Q12767 1356 aa43.74■■■■■ 4.59
FAM58A-202ENST00000440428 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP43.73■■■■■ 4.59
FAM58A-202ENST00000440428 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP43.72■■■■■ 4.59
FAM58A-202ENST00000440428 HFM1A2PYH4 1435 aa43.72■■■■■ 4.59
FAM58A-202ENST00000440428 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP43.71■■■■■ 4.59
FAM58A-202ENST00000440428 ILDR2Q71H61 639 aa43.7■■■■■ 4.59
FAM58A-202ENST00000440428 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP43.69■■■■■ 4.58
FAM58A-202ENST00000440428 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP43.68■■■■■ 4.58
FAM58A-202ENST00000440428 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa43.66■■■■■ 4.58
FAM58A-202ENST00000440428 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
FAM58A-202ENST00000440428 TBX22Q9Y458 520 aa43.65■■■■■ 4.58
FAM58A-202ENST00000440428 CLTCL1P53675 1640 aa43.59■■■■■ 4.57
FAM58A-202ENST00000440428 TRPM2O94759 1503 aa43.58■■■■■ 4.57
FAM58A-202ENST00000440428 DIP2AQ14689 1571 aa43.57■■■■■ 4.57
FAM58A-202ENST00000440428 TRIM52Q96A61 297 aa43.54■■■■■ 4.56
FAM58A-202ENST00000440428 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
FAM58A-202ENST00000440428 FAM135BQ49AJ0 1406 aa43.5■■■■■ 4.55
FAM58A-202ENST00000440428 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa43.5■■■■■ 4.55
FAM58A-202ENST00000440428 PIK3R4Q99570 1358 aa43.48■■■■■ 4.55
FAM58A-202ENST00000440428 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
FAM58A-202ENST00000440428 KIF1BO60333 1816 aa43.45■■■■■ 4.55
FAM58A-202ENST00000440428 MSH6P52701 1360 aa43.44■■■■■ 4.54
FAM58A-202ENST00000440428 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa43.44■■■■■ 4.54
FAM58A-202ENST00000440428 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa43.43■■■■■ 4.54
FAM58A-202ENST00000440428 PTPRUQ92729 1446 aa43.43■■■■■ 4.54
FAM58A-202ENST00000440428 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
FAM58A-202ENST00000440428 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa43.41■■■■■ 4.54
FAM58A-202ENST00000440428 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa43.39■■■■■ 4.54
FAM58A-202ENST00000440428 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa43.35■■■■■ 4.53
FAM58A-202ENST00000440428 SLAIN2Q9P270 581 aa43.31■■■■■ 4.52
FAM58A-202ENST00000440428 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
FAM58A-202ENST00000440428 METP08581 1390 aa43.29■■■■■ 4.52
FAM58A-202ENST00000440428 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
FAM58A-202ENST00000440428 FOXD1Q16676 465 aa43.28■■■■■ 4.52
FAM58A-202ENST00000440428 SOCS7O14512 581 aa43.27■■■■■ 4.52
FAM58A-202ENST00000440428 C14orf37Q86TY3 774 aa43.23■■■■■ 4.51
FAM58A-202ENST00000440428 C19orf44Q9H6X5 657 aa43.22■■■■■ 4.51
FAM58A-202ENST00000440428 MPHOSPH9Q99550 1183 aa43.18■■■■■ 4.5
FAM58A-202ENST00000440428 PPLO60437 1756 aa43.17■■■■■ 4.5
FAM58A-202ENST00000440428 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP43.16■■■■■ 4.5
FAM58A-202ENST00000440428 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa43.16■■■■■ 4.5
FAM58A-202ENST00000440428 CADPS2Q86UW7 1296 aa43.15■■■■■ 4.5
FAM58A-202ENST00000440428 VGFO15240 615 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
FAM58A-202ENST00000440428 PHLPP1O60346 1717 aa43.14■■■■■ 4.5
FAM58A-202ENST00000440428 ATF3P18847 181 aa43.11■■■■■ 4.49
FAM58A-202ENST00000440428 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP43.11■■■■■ 4.49
FAM58A-202ENST00000440428 SETD5Q9C0A6 1442 aa43.1■■■■■ 4.49
FAM58A-202ENST00000440428 CCDC144AA2RUR9 1427 aa43.06■■■■■ 4.48
FAM58A-202ENST00000440428 DCCP43146 1447 aa43.06■■■■■ 4.48
FAM58A-202ENST00000440428 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
FAM58A-202ENST00000440428 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa43.04■■■■■ 4.48
FAM58A-202ENST00000440428 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP43■■■■■ 4.47
FAM58A-202ENST00000440428 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
FAM58A-202ENST00000440428 NALCNQ8IZF0 1738 aa42.98■■■■■ 4.47
FAM58A-202ENST00000440428 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa42.97■■■■■ 4.47
FAM58A-202ENST00000440428 IFT172Q9UG01 1749 aa42.97■■■■■ 4.47
FAM58A-202ENST00000440428 BRINP3Q76B58 766 aa42.96■■■■■ 4.47
FAM58A-202ENST00000440428 MST1RQ04912 1400 aa42.96■■■■■ 4.47
FAM58A-202ENST00000440428 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
FAM58A-202ENST00000440428 PTCH1Q13635 1447 aa42.95■■■■■ 4.47
FAM58A-202ENST00000440428 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa42.95■■■■■ 4.47
FAM58A-202ENST00000440428 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.94■■■■■ 4.46
FAM58A-202ENST00000440428 JCADQ9P266 1359 aa42.94■■■■■ 4.46
FAM58A-202ENST00000440428 RGL3Q3MIN7 710 aa42.94■■■■■ 4.46
FAM58A-202ENST00000440428 ROBO2Q9HCK4 1378 aa42.93■■■■■ 4.46
FAM58A-202ENST00000440428 PRAG1Q86YV5 1406 aa42.93■■■■■ 4.46
FAM58A-202ENST00000440428 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa42.87■■■■■ 4.45
FAM58A-202ENST00000440428 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa42.85■■■■■ 4.45
FAM58A-202ENST00000440428 NHSL1Q5SYE7 1610 aa42.8■■■■■ 4.44
FAM58A-202ENST00000440428 SHPRHQ149N8 1683 aa42.79■■■■■ 4.44
FAM58A-202ENST00000440428 PIK3C2GO75747 1445 aa42.76■■■■■ 4.44
FAM58A-202ENST00000440428 LRP6O75581 1613 aa42.75■■■■■ 4.43
FAM58A-202ENST00000440428 C1orf167Q5SNV9 1468 aa42.74■■■■■ 4.43
FAM58A-202ENST00000440428 POTEAQ6S8J7 498 aa42.73■■■■■ 4.43
FAM58A-202ENST00000440428 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa42.72■■■■■ 4.43
FAM58A-202ENST00000440428 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
FAM58A-202ENST00000440428 TECPR2O15040 1411 aa42.69■■■■■ 4.42
FAM58A-202ENST00000440428 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
FAM58A-202ENST00000440428 TMEM132EQ6IEE7 984 aa42.67■■■■■ 4.42
FAM58A-202ENST00000440428 NRXN1Q9ULB1 1477 aa42.66■■■■■ 4.42
FAM58A-202ENST00000440428 STK26Q9P289 416 aa42.65■■■■■ 4.42
FAM58A-202ENST00000440428 KNDC1Q76NI1 1749 aa42.64■■■■■ 4.42
FAM58A-202ENST00000440428 ABCC11Q96J66 1382 aa42.63■■■■■ 4.41
FAM58A-202ENST00000440428 LAMC1P11047 1609 aa42.62■■■■■ 4.41
FAM58A-202ENST00000440428 HRCP23327 699 aa42.62■■■■■ 4.41
FAM58A-202ENST00000440428 MYOM2P54296 1465 aa42.62■■■■■ 4.41
FAM58A-202ENST00000440428 WAPLQ7Z5K2 1190 aa42.61■■■■■ 4.41
FAM58A-202ENST00000440428 ORAI2Q96SN7 254 aa42.61■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms