RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439365.6

NPAS1-201, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NPAS1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-201ENST00000439365 HSPA1LP34931 641 aa29.64■■■□□ 2.34
NPAS1-201ENST00000439365 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.61■■■□□ 2.33
NPAS1-201ENST00000439365 KCNA6P17658 529 aa29.59■■■□□ 2.33
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.58■■■□□ 2.33
NPAS1-201ENST00000439365 ZFYVE9O95405 1425 aa29.57■■■□□ 2.32
NPAS1-201ENST00000439365 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.57■■■□□ 2.32
NPAS1-201ENST00000439365 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
NPAS1-201ENST00000439365 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.32
NPAS1-201ENST00000439365 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
NPAS1-201ENST00000439365 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa29.54■■■□□ 2.32
NPAS1-201ENST00000439365 ALKQ9UM73 1620 aa29.54■■■□□ 2.32
NPAS1-201ENST00000439365 NAIPQ13075 1403 aa29.53■■■□□ 2.32
NPAS1-201ENST00000439365 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM94Q12767 1356 aa29.52■■■□□ 2.32
NPAS1-201ENST00000439365 TRIM52Q96A61 297 aa29.51■■■□□ 2.32
NPAS1-201ENST00000439365 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
NPAS1-201ENST00000439365 ILDR2Q71H61 639 aa29.46■■■□□ 2.31
NPAS1-201ENST00000439365 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
NPAS1-201ENST00000439365 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.44■■■□□ 2.3
NPAS1-201ENST00000439365 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
NPAS1-201ENST00000439365 HFM1A2PYH4 1435 aa29.44■■■□□ 2.3
NPAS1-201ENST00000439365 TBX22Q9Y458 520 aa29.44■■■□□ 2.3
NPAS1-201ENST00000439365 NWD1Q149M9 1564 aa29.41■■■□□ 2.3
NPAS1-201ENST00000439365 MSH6P52701 1360 aa29.37■■■□□ 2.29
NPAS1-201ENST00000439365 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
NPAS1-201ENST00000439365 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa29.37■■■□□ 2.29
NPAS1-201ENST00000439365 C14orf37Q86TY3 774 aa29.36■■■□□ 2.29
NPAS1-201ENST00000439365 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
NPAS1-201ENST00000439365 DIP2AQ14689 1571 aa29.34■■■□□ 2.29
NPAS1-201ENST00000439365 TRPM2O94759 1503 aa29.32■■■□□ 2.28
NPAS1-201ENST00000439365 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
NPAS1-201ENST00000439365 CLTCL1P53675 1640 aa29.32■■■□□ 2.28
NPAS1-201ENST00000439365 FAM135BQ49AJ0 1406 aa29.31■■■□□ 2.28
NPAS1-201ENST00000439365 PIK3R4Q99570 1358 aa29.29■■■□□ 2.28
NPAS1-201ENST00000439365 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
NPAS1-201ENST00000439365 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa29.29■■■□□ 2.28
NPAS1-201ENST00000439365 SLAIN2Q9P270 581 aa29.26■■■□□ 2.27
NPAS1-201ENST00000439365 SOCS7O14512 581 aa29.23■■■□□ 2.27
NPAS1-201ENST00000439365 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa29.23■■■□□ 2.27
NPAS1-201ENST00000439365 FOXD1Q16676 465 aa29.22■■■□□ 2.27
NPAS1-201ENST00000439365 KIF1BO60333 1816 aa29.22■■■□□ 2.27
NPAS1-201ENST00000439365 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa29.22■■■□□ 2.27
NPAS1-201ENST00000439365 PTPRUQ92729 1446 aa29.21■■■□□ 2.27
NPAS1-201ENST00000439365 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa29.21■■■□□ 2.27
NPAS1-201ENST00000439365 ATF3P18847 181 aa29.2■■■□□ 2.27
NPAS1-201ENST00000439365 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.2■■■□□ 2.27
NPAS1-201ENST00000439365 C19orf44Q9H6X5 657 aa29.2■■■□□ 2.26
NPAS1-201ENST00000439365 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa29.19■■■□□ 2.26
NPAS1-201ENST00000439365 CADPS2Q86UW7 1296 aa29.18■■■□□ 2.26
NPAS1-201ENST00000439365 METP08581 1390 aa29.17■■■□□ 2.26
NPAS1-201ENST00000439365 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
NPAS1-201ENST00000439365 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.15■■■□□ 2.26
NPAS1-201ENST00000439365 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.12■■■□□ 2.25
NPAS1-201ENST00000439365 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
NPAS1-201ENST00000439365 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.1■■■□□ 2.25
NPAS1-201ENST00000439365 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
NPAS1-201ENST00000439365 RGL3Q3MIN7 710 aa29.07■■■□□ 2.24
NPAS1-201ENST00000439365 PHLPP1O60346 1717 aa29.07■■■□□ 2.24
NPAS1-201ENST00000439365 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.07■■■□□ 2.24
NPAS1-201ENST00000439365 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
NPAS1-201ENST00000439365 JCADQ9P266 1359 aa29.01■■■□□ 2.23
NPAS1-201ENST00000439365 DCCP43146 1447 aa29.01■■■□□ 2.23
NPAS1-201ENST00000439365 BRINP3Q76B58 766 aa28.98■■■□□ 2.23
NPAS1-201ENST00000439365 PPLO60437 1756 aa28.98■■■□□ 2.23
NPAS1-201ENST00000439365 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.96■■■□□ 2.23
NPAS1-201ENST00000439365 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.96■■■□□ 2.23
NPAS1-201ENST00000439365 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.95■■■□□ 2.23
NPAS1-201ENST00000439365 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
NPAS1-201ENST00000439365 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
NPAS1-201ENST00000439365 MST1RQ04912 1400 aa28.93■■■□□ 2.22
NPAS1-201ENST00000439365 PTCH1Q13635 1447 aa28.93■■■□□ 2.22
NPAS1-201ENST00000439365 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.93■■■□□ 2.22
NPAS1-201ENST00000439365 ROBO2Q9HCK4 1378 aa28.93■■■□□ 2.22
NPAS1-201ENST00000439365 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
NPAS1-201ENST00000439365 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.92■■■□□ 2.22
NPAS1-201ENST00000439365 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
NPAS1-201ENST00000439365 NALCNQ8IZF0 1738 aa28.89■■■□□ 2.22
NPAS1-201ENST00000439365 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.89■■■□□ 2.22
NPAS1-201ENST00000439365 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
NPAS1-201ENST00000439365 STK26Q9P289 416 aa28.88■■■□□ 2.21
NPAS1-201ENST00000439365 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.86■■■□□ 2.21
NPAS1-201ENST00000439365 POTEAQ6S8J7 498 aa28.83■■■□□ 2.21
NPAS1-201ENST00000439365 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
NPAS1-201ENST00000439365 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.82■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 IFT172Q9UG01 1749 aa28.81■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 C1orf167Q5SNV9 1468 aa28.8■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.8■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 PIK3C2GO75747 1445 aa28.79■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 LRP6O75581 1613 aa28.77■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.77■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 ORAI2Q96SN7 254 aa28.77■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 SHPRHQ149N8 1683 aa28.77■■■□□ 2.2
NPAS1-201ENST00000439365 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
NPAS1-201ENST00000439365 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.76■■■□□ 2.19
NPAS1-201ENST00000439365 ABCC11Q96J66 1382 aa28.72■■■□□ 2.19
NPAS1-201ENST00000439365 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.71■■■□□ 2.19
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