RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 POLR3EQ9NVU0 708 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 FLIIQ13045 1269 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRC-205ENST00000391970 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 RDH13Q8NBN7 331 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 ZMYND15Q9H091 742 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 TK2O00142 265 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 SPTLC1O15269 473 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 SLC10A3P09131 477 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 NBPF3Q9H094 633 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 KDM4AO75164 1064 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 GJA5P36382 358 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 GCGRP47871 477 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 MCM6Q14566 821 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 USP46P62068 366 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 PPP2R2DQ66LE6 453 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 PCDH10Q9P2E7 1040 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 HOXA2O43364 376 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 NDUFV2P19404 249 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 RFC5P40937 340 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 SLF2Q8IX21 1173 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-205ENST00000391970 SLC4A3P48751 1232 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 HRO43593 1189 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 LILRB3O75022 631 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 QPCTQ16769 361 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 BANK1Q8NDB2 785 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 CFHP08603 1231 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 FDX1P10109 184 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 A6NJR5 290 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 RNF40O75150 1001 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 HLA-CQ95604 372 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 GUCA2AQ02747 115 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 FUT2Q10981 343 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 CLUAP1Q96AJ1 413 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 LRCH3Q96II8 777 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 HRCP23327 699 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 NECTIN2Q92692 538 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 SNRKQ9NRH2 765 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 SOCS7O14512 581 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 ATP6V1AP38606 617 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 POM121Q96HA1 1249 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRC-205ENST00000391970 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms