RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389395.7

MFSD12-202, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 12, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MFSD12, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD12-202ENST00000389395 STAC3Q96MF2 364 aa35.92■■■■□ 3.34
MFSD12-202ENST00000389395 IFT172Q9UG01 1749 aa35.91■■■■□ 3.34
MFSD12-202ENST00000389395 NLRP1Q9C000 1473 aa35.9■■■■□ 3.34
MFSD12-202ENST00000389395 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa35.89■■■■□ 3.34
MFSD12-202ENST00000389395 PPLO60437 1756 aa35.88■■■■□ 3.33
MFSD12-202ENST00000389395 MYOM2P54296 1465 aa35.87■■■■□ 3.33
MFSD12-202ENST00000389395 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.86■■■■□ 3.33
MFSD12-202ENST00000389395 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.83■■■■□ 3.33
MFSD12-202ENST00000389395 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.83■■■■□ 3.33
MFSD12-202ENST00000389395 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
MFSD12-202ENST00000389395 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.82■■■■□ 3.33
MFSD12-202ENST00000389395 MYO3AQ8NEV4 1616 aa35.82■■■■□ 3.32
MFSD12-202ENST00000389395 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
MFSD12-202ENST00000389395 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
MFSD12-202ENST00000389395 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.81■■■■□ 3.32
MFSD12-202ENST00000389395 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.8■■■■□ 3.32
MFSD12-202ENST00000389395 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.32
MFSD12-202ENST00000389395 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
MFSD12-202ENST00000389395 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.78■■■■□ 3.32
MFSD12-202ENST00000389395 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.77■■■■□ 3.32
MFSD12-202ENST00000389395 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.77■■■■□ 3.32
MFSD12-202ENST00000389395 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
MFSD12-202ENST00000389395 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.76■■■■□ 3.32
MFSD12-202ENST00000389395 PIK3C2GO75747 1445 aa35.74■■■■□ 3.31
MFSD12-202ENST00000389395 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.74■■■■□ 3.31
MFSD12-202ENST00000389395 ZFYVE9O95405 1425 aa35.74■■■■□ 3.31
MFSD12-202ENST00000389395 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
MFSD12-202ENST00000389395 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
MFSD12-202ENST00000389395 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
MFSD12-202ENST00000389395 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP35.67■■■■□ 3.3
MFSD12-202ENST00000389395 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.67■■■■□ 3.3
MFSD12-202ENST00000389395 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
MFSD12-202ENST00000389395 LTKP29376 864 aa35.65■■■■□ 3.3
MFSD12-202ENST00000389395 HDGFP51858 240 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
MFSD12-202ENST00000389395 USP47Q96K76 1375 aa35.65■■■■□ 3.3
MFSD12-202ENST00000389395 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.62■■■■□ 3.29
MFSD12-202ENST00000389395 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.62■■■■□ 3.29
MFSD12-202ENST00000389395 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
MFSD12-202ENST00000389395 SLIT1O75093 1534 aa35.6■■■■□ 3.29
MFSD12-202ENST00000389395 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.59■■■■□ 3.29
MFSD12-202ENST00000389395 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.59■■■■□ 3.29
MFSD12-202ENST00000389395 EID1Q9Y6B2 187 aa35.59■■■■□ 3.29
MFSD12-202ENST00000389395 MYT1Q01538 1121 aa35.57■■■■□ 3.28
MFSD12-202ENST00000389395 LAMC1P11047 1609 aa35.54■■■■□ 3.28
MFSD12-202ENST00000389395 BCANQ96GW7 911 aa35.54■■■■□ 3.28
MFSD12-202ENST00000389395 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
MFSD12-202ENST00000389395 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.52■■■■□ 3.28
MFSD12-202ENST00000389395 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
MFSD12-202ENST00000389395 ADGRB1O14514 1584 aa35.51■■■■□ 3.28
MFSD12-202ENST00000389395 ALKQ9UM73 1620 aa35.51■■■■□ 3.28
MFSD12-202ENST00000389395 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.5■■■■□ 3.27
MFSD12-202ENST00000389395 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
MFSD12-202ENST00000389395 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.49■■■■□ 3.27
MFSD12-202ENST00000389395 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa35.48■■■■□ 3.27
MFSD12-202ENST00000389395 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.47■■■■□ 3.27
MFSD12-202ENST00000389395 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.45■■■■□ 3.27
MFSD12-202ENST00000389395 IQGAP1P46940 1657 aa35.45■■■■□ 3.27
MFSD12-202ENST00000389395 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.45■■■■□ 3.27
MFSD12-202ENST00000389395 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.45■■■■□ 3.27
MFSD12-202ENST00000389395 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.41■■■■□ 3.26
MFSD12-202ENST00000389395 STK26Q9P289 416 aa35.41■■■■□ 3.26
MFSD12-202ENST00000389395 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.41■■■■□ 3.26
MFSD12-202ENST00000389395 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
MFSD12-202ENST00000389395 METP08581 1390 aa35.39■■■■□ 3.26
MFSD12-202ENST00000389395 CCDC7Q96M83 1385 aa35.36■■■■□ 3.25
MFSD12-202ENST00000389395 HSPA2P54652 639 aa35.36■■■■□ 3.25
MFSD12-202ENST00000389395 KIF7Q2M1P5 1343 aa35.36■■■■□ 3.25
MFSD12-202ENST00000389395 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
MFSD12-202ENST00000389395 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
MFSD12-202ENST00000389395 TESK2Q96S53 571 aa35.34■■■■□ 3.25
MFSD12-202ENST00000389395 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.33■■■■□ 3.25
MFSD12-202ENST00000389395 MED14O60244 1454 aa35.32■■■■□ 3.24
MFSD12-202ENST00000389395 MIER1Q8N108 512 aa35.31■■■■□ 3.24
MFSD12-202ENST00000389395 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.3■■■■□ 3.24
MFSD12-202ENST00000389395 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.3■■■■□ 3.24
MFSD12-202ENST00000389395 TBX22Q9Y458 520 aa35.28■■■■□ 3.24
MFSD12-202ENST00000389395 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
MFSD12-202ENST00000389395 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.24
MFSD12-202ENST00000389395 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
MFSD12-202ENST00000389395 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.23■■■■□ 3.23
MFSD12-202ENST00000389395 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
MFSD12-202ENST00000389395 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
MFSD12-202ENST00000389395 PRAM1Q96QH2 718 aa35.22■■■■□ 3.23
MFSD12-202ENST00000389395 ABCC11Q96J66 1382 aa35.21■■■■□ 3.23
MFSD12-202ENST00000389395 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.21■■■■□ 3.23
MFSD12-202ENST00000389395 PTPRUQ92729 1446 aa35.19■■■■□ 3.22
MFSD12-202ENST00000389395 DIP2AQ14689 1571 aa35.19■■■■□ 3.22
MFSD12-202ENST00000389395 TMF1P82094 1093 aa35.18■■■■□ 3.22
MFSD12-202ENST00000389395 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.18■■■■□ 3.22
MFSD12-202ENST00000389395 POGKQ9P215 609 aa35.18■■■■□ 3.22
MFSD12-202ENST00000389395 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.15■■■■□ 3.22
MFSD12-202ENST00000389395 QRICH2Q9H0J4 1663 aa35.14■■■■□ 3.22
MFSD12-202ENST00000389395 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.14■■■■□ 3.22
MFSD12-202ENST00000389395 DLC1Q96QB1 1528 aa35.13■■■■□ 3.21
MFSD12-202ENST00000389395 TECPR2O15040 1411 aa35.11■■■■□ 3.21
MFSD12-202ENST00000389395 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa35.11■■■■□ 3.21
MFSD12-202ENST00000389395 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.1■■■■□ 3.21
MFSD12-202ENST00000389395 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
MFSD12-202ENST00000389395 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.08■■■■□ 3.21
MFSD12-202ENST00000389395 PIK3R4Q99570 1358 aa35.07■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms