RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366672.4

GALNT2-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT2, Length 4,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT2-201ENST00000366672 GGNBP2Q9H3C7 697 aa23.26■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 RIPK4P57078 832 aa23.25■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 RAPGEF3O95398 923 aa23.24■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 COG6Q9Y2V7 657 aa23.24■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 ADAMTS8Q9UP79 889 aa23.23■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.22■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.22■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 WDR97A6NE52 1622 aa23.22■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.22■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.22■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 PDE4AP27815 886 aa23.22■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.21■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 MTHFSP49914 203 aa23.21■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 PPP2R1AP30153 589 aa23.21■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.31
GALNT2-201ENST00000366672 GBP4Q96PP9 640 aa23.2■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.2■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.19■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 AKNAQ7Z591 1439 aa23.19■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 PTMSP20962 102 aa23.19■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 TEFQ10587 303 aa23.19■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 NCOA1Q15788 1441 aa23.18■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 FAM161AQ3B820 660 aa23.18■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.17■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 PSME1Q06323 249 aa23.17■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.16■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.16■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.15■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 GPATCH3Q96I76 525 aa23.15■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 PRAM1Q96QH2 718 aa23.15■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.14■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 GNAI1P63096 354 aa23.14■■□□□ 1.3
GALNT2-201ENST00000366672 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.13■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 USP35Q9P2H5 1018 aa23.13■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.12■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 ERBINQ96RT1 1412 aa23.11■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 KIF14Q15058 1648 aa23.11■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 KIF16BQ96L93 1317 aa23.1■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.1■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 HMOX1P09601 288 aa23.1■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 PLCB2Q00722 1185 aa23.09■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 AAMPQ13685 434 aa23.09■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.09■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 CD109Q6YHK3 1445 aa23.08■■□□□ 1.29
GALNT2-201ENST00000366672 GORABQ5T7V8 394 aa23.08■■□□□ 1.28
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
GALNT2-201ENST00000366672 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.07■■□□□ 1.28
GALNT2-201ENST00000366672 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.07■■□□□ 1.28
GALNT2-201ENST00000366672 NLRP6P59044 892 aa23.06■■□□□ 1.28
GALNT2-201ENST00000366672 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.06■■□□□ 1.28
GALNT2-201ENST00000366672 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
GALNT2-201ENST00000366672 CDK19Q9BWU1 502 aa23.02■■□□□ 1.28
GALNT2-201ENST00000366672 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 ADGRL1O94910 1474 aa23.01■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 CABP1Q9NZU7 370 aa23.01■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC184Q52MB2 194 aa23■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 EVA1CP58658 441 aa22.99■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.99■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 ATF3P18847 181 aa22.99■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.99■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.99■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 NRDCO43847 1150 aa22.98■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.98■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 ST18O60284 1047 aa22.98■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 PRKAR2BP31323 418 aa22.98■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 ATAD2Q6PL18 1390 aa22.97■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 PANK1Q8TE04 598 aa22.96■■□□□ 1.27
GALNT2-201ENST00000366672 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.95■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.94■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.94■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.93■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 ABTB2Q8N961 1025 aa22.93■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.93■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 ATP10BO94823 1461 aa22.92■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 NECTIN2Q92692 538 aa22.92■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 RILPL2Q969X0 211 aa22.92■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 PDE3AQ14432 1141 aa22.92■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.91■■□□□ 1.26
GALNT2-201ENST00000366672 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.5 ms