RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 E9PCH4 1651 aa38.49■■■■□ 3.75
PPP4R4-202ENST00000328839 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
PPP4R4-202ENST00000328839 ROCK1Q13464 1354 aa38.47■■■■□ 3.75
PPP4R4-202ENST00000328839 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa38.47■■■■□ 3.75
PPP4R4-202ENST00000328839 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
PPP4R4-202ENST00000328839 ITGAEP38570 1179 aa38.46■■■■□ 3.75
PPP4R4-202ENST00000328839 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP38.46■■■■□ 3.75
PPP4R4-202ENST00000328839 NWD1Q149M9 1564 aa38.45■■■■□ 3.75
PPP4R4-202ENST00000328839 ZFYVE9O95405 1425 aa38.45■■■■□ 3.75
PPP4R4-202ENST00000328839 CHGAP10645 457 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
PPP4R4-202ENST00000328839 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.44■■■■□ 3.74
PPP4R4-202ENST00000328839 RIMS2Q9UQ26 1411 aa38.44■■■■□ 3.74
PPP4R4-202ENST00000328839 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
PPP4R4-202ENST00000328839 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
PPP4R4-202ENST00000328839 HDGFP51858 240 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
PPP4R4-202ENST00000328839 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa38.4■■■■□ 3.74
PPP4R4-202ENST00000328839 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM135BQ49AJ0 1406 aa38.37■■■■□ 3.73
PPP4R4-202ENST00000328839 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa38.36■■■■□ 3.73
PPP4R4-202ENST00000328839 NUP155O75694 1391 aa38.34■■■■□ 3.73
PPP4R4-202ENST00000328839 MSH6P52701 1360 aa38.31■■■■□ 3.72
PPP4R4-202ENST00000328839 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
PPP4R4-202ENST00000328839 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP38.3■■■■□ 3.72
PPP4R4-202ENST00000328839 TBX22Q9Y458 520 aa38.23■■■■□ 3.71
PPP4R4-202ENST00000328839 DIP2AQ14689 1571 aa38.2■■■■□ 3.71
PPP4R4-202ENST00000328839 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa38.19■■■■□ 3.7
PPP4R4-202ENST00000328839 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa38.18■■■■□ 3.7
PPP4R4-202ENST00000328839 C14orf37Q86TY3 774 aa38.17■■■■□ 3.7
PPP4R4-202ENST00000328839 SLAIN2Q9P270 581 aa38.17■■■■□ 3.7
PPP4R4-202ENST00000328839 PHLPP1O60346 1717 aa38.17■■■■□ 3.7
PPP4R4-202ENST00000328839 TRPM2O94759 1503 aa38.11■■■■□ 3.69
PPP4R4-202ENST00000328839 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP38.1■■■■□ 3.69
PPP4R4-202ENST00000328839 PIK3R4Q99570 1358 aa38.08■■■■□ 3.69
PPP4R4-202ENST00000328839 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa38.08■■■■□ 3.69
PPP4R4-202ENST00000328839 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.69
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP38.05■■■■□ 3.68
PPP4R4-202ENST00000328839 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
PPP4R4-202ENST00000328839 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa38.01■■■■□ 3.68
PPP4R4-202ENST00000328839 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa38.01■■■■□ 3.67
PPP4R4-202ENST00000328839 PTPRUQ92729 1446 aa37.99■■■■□ 3.67
PPP4R4-202ENST00000328839 ATF3P18847 181 aa37.99■■■■□ 3.67
PPP4R4-202ENST00000328839 CLTCL1P53675 1640 aa37.98■■■■□ 3.67
PPP4R4-202ENST00000328839 CADPS2Q86UW7 1296 aa37.98■■■■□ 3.67
PPP4R4-202ENST00000328839 C19orf44Q9H6X5 657 aa37.98■■■■□ 3.67
PPP4R4-202ENST00000328839 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP37.98■■■■□ 3.67
PPP4R4-202ENST00000328839 JCADQ9P266 1359 aa37.97■■■■□ 3.67
PPP4R4-202ENST00000328839 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa37.97■■■■□ 3.67
PPP4R4-202ENST00000328839 KIF1BO60333 1816 aa37.95■■■■□ 3.67
PPP4R4-202ENST00000328839 NAIPQ13075 1403 aa37.95■■■■□ 3.67
PPP4R4-202ENST00000328839 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
PPP4R4-202ENST00000328839 POTEAQ6S8J7 498 aa37.91■■■■□ 3.66
PPP4R4-202ENST00000328839 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa37.88■■■■□ 3.65
PPP4R4-202ENST00000328839 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM52Q96A61 297 aa37.86■■■■□ 3.65
PPP4R4-202ENST00000328839 METP08581 1390 aa37.84■■■■□ 3.65
PPP4R4-202ENST00000328839 DCCP43146 1447 aa37.81■■■■□ 3.64
PPP4R4-202ENST00000328839 SHPRHQ149N8 1683 aa37.79■■■■□ 3.64
PPP4R4-202ENST00000328839 HFM1A2PYH4 1435 aa37.78■■■■□ 3.64
PPP4R4-202ENST00000328839 BRINP3Q76B58 766 aa37.78■■■■□ 3.64
PPP4R4-202ENST00000328839 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa37.77■■■■□ 3.64
PPP4R4-202ENST00000328839 LRP6O75581 1613 aa37.76■■■■□ 3.64
PPP4R4-202ENST00000328839 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa37.74■■■■□ 3.63
PPP4R4-202ENST00000328839 NALCNQ8IZF0 1738 aa37.73■■■■□ 3.63
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
PPP4R4-202ENST00000328839 MST1RQ04912 1400 aa37.71■■■■□ 3.63
PPP4R4-202ENST00000328839 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
PPP4R4-202ENST00000328839 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa37.7■■■■□ 3.62
PPP4R4-202ENST00000328839 NHSL1Q5SYE7 1610 aa37.67■■■■□ 3.62
PPP4R4-202ENST00000328839 VGFO15240 615 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
PPP4R4-202ENST00000328839 PPLO60437 1756 aa37.64■■■■□ 3.62
PPP4R4-202ENST00000328839 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
PPP4R4-202ENST00000328839 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
PPP4R4-202ENST00000328839 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
PPP4R4-202ENST00000328839 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa37.59■■■■□ 3.61
PPP4R4-202ENST00000328839 PTCH1Q13635 1447 aa37.57■■■■□ 3.6
PPP4R4-202ENST00000328839 SETD5Q9C0A6 1442 aa37.57■■■■□ 3.6
PPP4R4-202ENST00000328839 FOXD1Q16676 465 aa37.56■■■■□ 3.6
PPP4R4-202ENST00000328839 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
PPP4R4-202ENST00000328839 ROBO2Q9HCK4 1378 aa37.54■■■■□ 3.6
PPP4R4-202ENST00000328839 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
PPP4R4-202ENST00000328839 C1orf167Q5SNV9 1468 aa37.51■■■■□ 3.59
PPP4R4-202ENST00000328839 CCDC144AA2RUR9 1427 aa37.46■■■■□ 3.59
PPP4R4-202ENST00000328839 PNPLA6Q8IY17 1366 aa37.43■■■■□ 3.58
PPP4R4-202ENST00000328839 AFF2P51816 1311 aa37.43■■■■□ 3.58
PPP4R4-202ENST00000328839 PRAG1Q86YV5 1406 aa37.43■■■■□ 3.58
PPP4R4-202ENST00000328839 RGL3Q3MIN7 710 aa37.41■■■■□ 3.58
PPP4R4-202ENST00000328839 RXRBP28702 533 aa37.4■■■■□ 3.58
PPP4R4-202ENST00000328839 ORAI2Q96SN7 254 aa37.4■■■■□ 3.58
PPP4R4-202ENST00000328839 C8orf37Q96NL8 207 aa37.39■■■■□ 3.58
PPP4R4-202ENST00000328839 LAMC1P11047 1609 aa37.39■■■■□ 3.58
PPP4R4-202ENST00000328839 IFT172Q9UG01 1749 aa37.39■■■■□ 3.58
PPP4R4-202ENST00000328839 MPHOSPH9Q99550 1183 aa37.38■■■■□ 3.57
PPP4R4-202ENST00000328839 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa37.37■■■■□ 3.57
PPP4R4-202ENST00000328839 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa37.34■■■■□ 3.57
PPP4R4-202ENST00000328839 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa37.31■■■■□ 3.56
PPP4R4-202ENST00000328839 STK26Q9P289 416 aa37.31■■■■□ 3.56
PPP4R4-202ENST00000328839 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa37.3■■■■□ 3.56
PPP4R4-202ENST00000328839 ADAMTS2O95450 1211 aa37.3■■■■□ 3.56
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