RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 VGLL3A8MV65 326 aa22.13■■□□□ 1.13
GLIS1-201ENST00000312233 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
GLIS1-201ENST00000312233 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.13■■□□□ 1.13
GLIS1-201ENST00000312233 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.12■■□□□ 1.13
GLIS1-201ENST00000312233 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.11■■□□□ 1.13
GLIS1-201ENST00000312233 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.11■■□□□ 1.13
GLIS1-201ENST00000312233 KIF15Q9NS87 1388 aa22.11■■□□□ 1.13
GLIS1-201ENST00000312233 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GLIS1-201ENST00000312233 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.08■■□□□ 1.13
GLIS1-201ENST00000312233 ATP10BO94823 1461 aa22.08■■□□□ 1.12
GLIS1-201ENST00000312233 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
GLIS1-201ENST00000312233 RALBP1Q15311 655 aa22.07■■□□□ 1.12
GLIS1-201ENST00000312233 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.06■■□□□ 1.12
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
GLIS1-201ENST00000312233 ABCC2Q92887 1545 aa22.06■■□□□ 1.12
GLIS1-201ENST00000312233 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GLIS1-201ENST00000312233 ARHGEF11O15085 1522 aa22.04■■□□□ 1.12
GLIS1-201ENST00000312233 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GLIS1-201ENST00000312233 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GLIS1-201ENST00000312233 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
GLIS1-201ENST00000312233 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.02■■□□□ 1.12
GLIS1-201ENST00000312233 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 KLHL34Q8N239 644 aa22■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 USP47Q96K76 1375 aa22■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 HS1BP3Q53T59 392 aa21.99■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.99■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 NLRP13Q86W25 1043 aa21.99■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 IGHDP01880 384 aa21.98■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.98■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.98■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 CBX1P83916 185 aa21.98■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.97■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 TAF3Q5VWG9 929 aa21.97■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 KIF14Q15058 1648 aa21.96■■□□□ 1.11
GLIS1-201ENST00000312233 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.95■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.95■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 ZBTB22O15209 634 aa21.94■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.93■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.92■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.91■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.9■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 PANK3Q9H999 370 aa21.9■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 INSRP06213 1382 aa21.9■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.89■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 KDM6BO15054 1643 aa21.89■■□□□ 1.1
GLIS1-201ENST00000312233 DDIT3P35638 169 aa21.89■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 ATP2B3Q16720 1220 aa21.89■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.88■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.87■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.87■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.87■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 KDM5CP41229 1560 aa21.86■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 GBP4Q96PP9 640 aa21.86■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.85■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.85■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.84■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.84■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 MYRIPQ8NFW9 859 aa21.84■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 PTMSP20962 102 aa21.83■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 MCM5P33992 734 aa21.83■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.83■■□□□ 1.09
GLIS1-201ENST00000312233 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.82■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.82■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.82■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.82■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 HSCBQ8IWL3 235 aa21.8■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 TSC1Q92574 1164 aa21.8■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.79■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.79■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 ZMYM3Q14202 1370 aa21.79■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.79■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.79■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 IGSF3O75054 1194 aa21.78■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.78■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 MBD5Q9P267 1494 aa21.78■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 E9PCH4 1651 aa21.77■■□□□ 1.08
GLIS1-201ENST00000312233 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms