RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 E9PCH4 1651 aa25.77■■□□□ 1.72
TNNT1-201ENST00000291901 KCNA6P17658 529 aa25.77■■□□□ 1.72
TNNT1-201ENST00000291901 TMEM94Q12767 1356 aa25.77■■□□□ 1.72
TNNT1-201ENST00000291901 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
TNNT1-201ENST00000291901 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.75■■□□□ 1.71
TNNT1-201ENST00000291901 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TNNT1-201ENST00000291901 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
TNNT1-201ENST00000291901 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
TNNT1-201ENST00000291901 ZFYVE9O95405 1425 aa25.71■■□□□ 1.71
TNNT1-201ENST00000291901 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.71■■□□□ 1.71
TNNT1-201ENST00000291901 ROCK1Q13464 1354 aa25.71■■□□□ 1.71
TNNT1-201ENST00000291901 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.71■■□□□ 1.71
TNNT1-201ENST00000291901 NWD1Q149M9 1564 aa25.69■■□□□ 1.7
TNNT1-201ENST00000291901 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TNNT1-201ENST00000291901 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TNNT1-201ENST00000291901 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.67■■□□□ 1.7
TNNT1-201ENST00000291901 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.67■■□□□ 1.7
TNNT1-201ENST00000291901 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TNNT1-201ENST00000291901 NUP155O75694 1391 aa25.66■■□□□ 1.7
TNNT1-201ENST00000291901 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TNNT1-201ENST00000291901 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.64■■□□□ 1.7
TNNT1-201ENST00000291901 MSH6P52701 1360 aa25.61■■□□□ 1.69
TNNT1-201ENST00000291901 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
TNNT1-201ENST00000291901 TBX22Q9Y458 520 aa25.58■■□□□ 1.69
TNNT1-201ENST00000291901 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.55■■□□□ 1.68
TNNT1-201ENST00000291901 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.55■■□□□ 1.68
TNNT1-201ENST00000291901 SLAIN2Q9P270 581 aa25.55■■□□□ 1.68
TNNT1-201ENST00000291901 PHLPP1O60346 1717 aa25.54■■□□□ 1.68
TNNT1-201ENST00000291901 C14orf37Q86TY3 774 aa25.53■■□□□ 1.68
TNNT1-201ENST00000291901 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
TNNT1-201ENST00000291901 DIP2AQ14689 1571 aa25.51■■□□□ 1.67
TNNT1-201ENST00000291901 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
TNNT1-201ENST00000291901 TRPM2O94759 1503 aa25.47■■□□□ 1.67
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
TNNT1-201ENST00000291901 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.45■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.45■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 PTPRUQ92729 1446 aa25.44■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 PIK3R4Q99570 1358 aa25.44■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.43■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 CLTCL1P53675 1640 aa25.42■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 ATF3P18847 181 aa25.41■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.41■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 NAIPQ13075 1403 aa25.4■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 KIF1BO60333 1816 aa25.4■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 POTEAQ6S8J7 498 aa25.39■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.39■■□□□ 1.66
TNNT1-201ENST00000291901 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.38■■□□□ 1.65
TNNT1-201ENST00000291901 JCADQ9P266 1359 aa25.37■■□□□ 1.65
TNNT1-201ENST00000291901 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
TNNT1-201ENST00000291901 TRIM52Q96A61 297 aa25.36■■□□□ 1.65
TNNT1-201ENST00000291901 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.35■■□□□ 1.65
TNNT1-201ENST00000291901 METP08581 1390 aa25.34■■□□□ 1.65
TNNT1-201ENST00000291901 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TNNT1-201ENST00000291901 BRINP3Q76B58 766 aa25.29■■□□□ 1.64
TNNT1-201ENST00000291901 LRP6O75581 1613 aa25.27■■□□□ 1.64
TNNT1-201ENST00000291901 HFM1A2PYH4 1435 aa25.27■■□□□ 1.64
TNNT1-201ENST00000291901 SHPRHQ149N8 1683 aa25.26■■□□□ 1.63
TNNT1-201ENST00000291901 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TNNT1-201ENST00000291901 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TNNT1-201ENST00000291901 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TNNT1-201ENST00000291901 NALCNQ8IZF0 1738 aa25.25■■□□□ 1.63
TNNT1-201ENST00000291901 DCCP43146 1447 aa25.24■■□□□ 1.63
TNNT1-201ENST00000291901 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.24■■□□□ 1.63
TNNT1-201ENST00000291901 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.23■■□□□ 1.63
TNNT1-201ENST00000291901 MST1RQ04912 1400 aa25.23■■□□□ 1.63
TNNT1-201ENST00000291901 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TNNT1-201ENST00000291901 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TNNT1-201ENST00000291901 FOXD1Q16676 465 aa25.2■■□□□ 1.62
TNNT1-201ENST00000291901 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TNNT1-201ENST00000291901 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.2■■□□□ 1.62
TNNT1-201ENST00000291901 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.19■■□□□ 1.62
TNNT1-201ENST00000291901 PPLO60437 1756 aa25.19■■□□□ 1.62
TNNT1-201ENST00000291901 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TNNT1-201ENST00000291901 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TNNT1-201ENST00000291901 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.13■■□□□ 1.61
TNNT1-201ENST00000291901 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.12■■□□□ 1.61
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TNNT1-201ENST00000291901 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.12■■□□□ 1.61
TNNT1-201ENST00000291901 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TNNT1-201ENST00000291901 PTCH1Q13635 1447 aa25.1■■□□□ 1.61
TNNT1-201ENST00000291901 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.09■■□□□ 1.61
TNNT1-201ENST00000291901 RGL3Q3MIN7 710 aa25.07■■□□□ 1.6
TNNT1-201ENST00000291901 ORAI2Q96SN7 254 aa25.06■■□□□ 1.6
TNNT1-201ENST00000291901 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.05■■□□□ 1.6
TNNT1-201ENST00000291901 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.05■■□□□ 1.6
TNNT1-201ENST00000291901 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.04■■□□□ 1.6
TNNT1-201ENST00000291901 AFF2P51816 1311 aa25.04■■□□□ 1.6
TNNT1-201ENST00000291901 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.04■■□□□ 1.6
TNNT1-201ENST00000291901 IFT172Q9UG01 1749 aa25.03■■□□□ 1.6
TNNT1-201ENST00000291901 RXRBP28702 533 aa25.02■■□□□ 1.6
TNNT1-201ENST00000291901 C8orf37Q96NL8 207 aa25.01■■□□□ 1.59
TNNT1-201ENST00000291901 STK26Q9P289 416 aa25■■□□□ 1.59
TNNT1-201ENST00000291901 LAMC1P11047 1609 aa25■■□□□ 1.59
TNNT1-201ENST00000291901 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.99■■□□□ 1.59
TNNT1-201ENST00000291901 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.98■■□□□ 1.59
TNNT1-201ENST00000291901 ADAMTS2O95450 1211 aa24.97■■□□□ 1.59
TNNT1-201ENST00000291901 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.96■■□□□ 1.59
TNNT1-201ENST00000291901 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 680.2 ms