RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
CTIF-201ENST00000256413 APAF1O14727 1248 aa19.51■□□□□ 0.71
CTIF-201ENST00000256413 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
CTIF-201ENST00000256413 NUP155O75694 1391 aa19.51■□□□□ 0.71
CTIF-201ENST00000256413 PES1O00541 588 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
CTIF-201ENST00000256413 NGEFQ8N5V2 710 aa19.5■□□□□ 0.71
CTIF-201ENST00000256413 CLSTN1O94985 981 aa19.5■□□□□ 0.71
CTIF-201ENST00000256413 MCM4P33991 863 aa19.5■□□□□ 0.71
CTIF-201ENST00000256413 CHMP4CQ96CF2 233 aa19.5■□□□□ 0.71
CTIF-201ENST00000256413 RUFY1Q96T51 708 aa19.49■□□□□ 0.71
CTIF-201ENST00000256413 HDAC5Q9UQL6 1122 aa19.49■□□□□ 0.71
CTIF-201ENST00000256413 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
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CTIF-201ENST00000256413 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
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CTIF-201ENST00000256413 USP47Q96K76 1375 aa19.48■□□□□ 0.71
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CTIF-201ENST00000256413 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
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CTIF-201ENST00000256413 CCDC112Q8NEF3 446 aa19.45■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 AKNAQ7Z591 1439 aa19.45■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 PDE4CQ08493 712 aa19.44■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.43■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 CDR1P51861 262 aa19.43■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 ANO2Q9NQ90 1003 aa19.43■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 CDC45O75419 566 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 TSPYL1Q9H0U9 437 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 PANK1Q8TE04 598 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 KIF7Q2M1P5 1343 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 CBX1P83916 185 aa19.42■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 CEP89Q96ST8 783 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 ERICH4A6NGS2 130 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 RUFY2Q8WXA3 655 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.41■□□□□ 0.7
CTIF-201ENST00000256413 DEF6Q9H4E7 631 aa19.4■□□□□ 0.7
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CTIF-201ENST00000256413 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
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CTIF-201ENST00000256413 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa19.38■□□□□ 0.69
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CTIF-201ENST00000256413 CUX2O14529 1486 aa19.38■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
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CTIF-201ENST00000256413 FBXW7Q969H0 707 aa19.38■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP19.38■□□□□ 0.69
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CTIF-201ENST00000256413 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.37■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa19.37■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 TAF7LQ5H9L4 462 aa19.37■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 USP8P40818 1118 aa19.36■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 RABEP1Q15276 862 aa19.36■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 MPNDQ8N594 471 aa19.36■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.36■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 DCTN1Q14203 1278 aa19.36■□□□□ 0.69
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CTIF-201ENST00000256413 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.35■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 STK26Q9P289 416 aa19.34■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.34■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa19.34■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 TERF2IPQ9NYB0 399 aa19.34■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.69
CTIF-201ENST00000256413 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa19.32■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 MCM2P49736 904 aa19.32■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 RNF20Q5VTR2 975 aa19.3■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 PDILTQ8N807 584 aa19.3■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 CECR2Q9BXF3 1484 aa19.3■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 KIAA0754O94854 1291 aa19.29■□□□□ 0.68
CTIF-201ENST00000256413 CCDC192P0DO97 292 aa19.29■□□□□ 0.68
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