RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abca8aQ8K442 1620 aa28.35■■■□□ 2.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P3h3Q8CG70 732 aa28.34■■■□□ 2.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa28.34■■■□□ 2.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 ErbinQ80TH2 1402 aa28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pank3Q8R2W9 370 aa28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgrl3Q80TS3 1537 aa28.32■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Depdc5P61460 1591 aa28.31■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zscan21Q07231 555 aa28.31■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dip2cE9PWR4 1557 aa28.29■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kiaa0556Q8C753 1610 aa28.29■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 RereQ80TZ9 1558 aa28.29■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa28.28■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tex14Q7M6U3 1450 aa28.28■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Srcin1Q9QWI6 1250 aa28.28■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kdm2aP59997 1161 aa28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stk24Q99KH8 431 aa28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trpm1Q2TV84 1622 aa28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AdgbG3UZ78 1657 aa28.27■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmf1B9EKI3 1091 aa28.26■■■□□ 2.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zscan10Q3URR7 782 aa28.26■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa28.25■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Inpp5dQ9ES52 1191 aa28.25■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa28.25■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 L3mbtl2P59178 703 aa28.25■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cul9Q80TT8 1865 aa28.24■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rims1Q99NE5 1463 aa28.23■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa28.22■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kank1E9Q238 1360 aa28.22■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa28.21■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AatkQ80YE4 1365 aa28.21■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q7TT23 1179 aa28.2■■■□□ 2.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Akap12Q9WTQ5 1684 aa28.19■■■□□ 2.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myo3aQ8K3H5 1613 aa28.17■■■□□ 2.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Efcab6Q6P1E8 1516 aa28.16■■■□□ 2.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm20521D3Z5F7 333 aa28.15■■■□□ 2.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Os9Q8K2C7 672 aa28.15■■■□□ 2.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myom2Q14BI5 1463 aa28.15■■■□□ 2.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tecpr2Q3UH45 1423 aa28.15■■■□□ 2.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa28.14■■■□□ 2.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa28.14■■■□□ 2.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc4a1apE9PX68 744 aa28.13■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stard8Q8K031 1019 aa28.13■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ino80Q6ZPV2 1559 aa28.13■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 DnmbpQ6TXD4 1580 aa28.13■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nphp4P59240 1425 aa28.12■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam184bQ0KK56 942 aa28.12■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Yeats2Q3TUF7 1407 aa28.12■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Supt16hQ920B9 1047 aa28.09■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Erbb3Q61526 1339 aa28.08■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttc37F8VPK0 1563 aa28.08■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Talpid3E9PV87 1520 aa28.08■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rab3gap2Q8BMG7 1366 aa28.08■■■□□ 2.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Uggt1Q6P5E4 1551 aa28.06■■■□□ 2.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fan1Q69ZT1 1020 aa28.06■■■□□ 2.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cfap65Q3V0B4 1847 aa28.05■■■□□ 2.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp2r1aQ76MZ3 589 aa28.05■■■□□ 2.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gtf2e1Q9D0D5 440 aa28.05■■■□□ 2.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mink1Q9JM52 1308 aa28.03■■■□□ 2.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa28.03■■■□□ 2.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atf7ipQ7TT18 1306 aa28.03■■■□□ 2.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp40Q8BWR4 1235 aa28.02■■■□□ 2.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adamts7Q68SA9 1657 aa28.02■■■□□ 2.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Synj2Q9D2G5 1434 aa28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hecw2Q6I6G8 1578 aa28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plxnc1Q9QZC2 1574 aa28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Knl1Q66JQ7 1612 aa28.01■■■□□ 2.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myom1Q62234 1667 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mroh1E0CZ22 1640 aa27.96■■■□□ 2.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Puf60Q3UEB3 564 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AU022751B1B0V2 589 aa27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ttc41Q692V3 1318 aa27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ift172Q6VH22 1749 aa27.94■■■□□ 2.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rtl5Q5DTT4 599 aa27.92■■■□□ 2.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Esx1O88933 382 aa27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif7B7ZNG0 1348 aa27.89■■■□□ 2.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Liat1Q810M6 228 aa27.89■■■□□ 2.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif16bB1AVY7 1312 aa27.89■■■□□ 2.05
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Skint5A7XUY5 1461 aa27.89■■■□□ 2.05
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MaddQ80U28 1577 aa27.87■■■□□ 2.05
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gprasp1Q5U4C1 1347 aa27.87■■■□□ 2.05
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnh8P59111 1102 aa27.87■■■□□ 2.05
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PalldQ9ET54 1408 aa27.85■■■□□ 2.05
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TnikP83510 1323 aa27.84■■■□□ 2.05
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lrrc7Q80TE7 1490 aa27.83■■■□□ 2.05
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif2ak4Q9QZ05 1648 aa27.81■■■□□ 2.04
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hfm1D3Z4R1 1434 aa27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.1 ms