RNA–Protein interactions for RNA: YJR055W

HIT1, Transcript of Protein involved in C/D snoRNP assembly, yeast

Gene HIT1, Length 495 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HIT1	YJR055W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	DSF1	P0CX08	502 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	CCA1	P21269	546 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	SCM4	P32564	187 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	DOA4	P32571	926 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	ECM13	P38195	257 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	CUE1	P38428	203 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.93	□□□□□ -2.26	not detected
HIT1	YJR055W	YHR125W	P38831	101 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.93	□□□□□ -2.26	not detected
HIT1	YJR055W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.93	□□□□□ -2.26	not detected
HIT1	YJR055W	YIL001W	P40560	513 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YFR054C	P43622	192 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	RMR1	P53060	241 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YGL159W	P53110	370 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	MRH4	P53166	561 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YMR279C	Q03263	540 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	ATG39	Q06159	398 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	RRT8	Q08219	342 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	MSH5	Q12175	901 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		0.93	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	FCY2	P17064	533 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	PPH21	P23594	369 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YCR102C	P25608	368 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	MRX3	P38172	270 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YAR068W	P39564	161 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YAR1	P46683	200 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YGR219W	P53307	113 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	RRN5	Q02983	363 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	RSM10	Q03201	203 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YMD8	Q03697	442 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	FAR8	Q05040	523 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	COQ10	Q08058	207 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	BOL1	Q3E793	110 aa		0.92	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	Q0255	P03881	472 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YOR062C	P36025	268 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	GOS1	P38736	223 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	PRM10	P42946	383 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	GLG2	P47011	380 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	ERG25	P53045	309 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	GTR2	P53290	341 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	PET117	Q02771	107 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YML108W	Q03759	105 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	KRE28	Q04431	385 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YML096W	Q04489	525 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YLR030W	Q07967	263 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YOR186W	Q08560	144 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	AKR2	Q12013	749 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YLR126C	Q12288	251 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	EMP46	Q12396	444 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
HIT1	YJR055W	SGA1	P08019	549 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	MRPL25	P23369	157 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	MSN4	P33749	630 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	FMC1	P40491	155 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	YJR079W	P47126	109 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	HEM25	Q07534	307 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	YOL024W	Q08172	172 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	CSM4	Q08955	156 aa		0.9	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	MSW1	P04803	379 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	RIB1	P38066	345 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	YBR063C	P38083	404 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	LDB7	P38210	180 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	ERV15	P38312	142 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	CAT5	P41735	233 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	YGL034C	P53186	121 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	YPR172W	Q06608	200 aa		0.89	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	COX5A	P00424	153 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	HAP2	P06774	265 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	PEX4	P29340	183 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	SSO1	P32867	290 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	TVP38	P36164	337 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	YBR096W	P38256	230 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	TCD1	P38756	429 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	PEP8	P40335	379 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	NUP84	P52891	726 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	CAB4	P53332	305 aa		0.88	□□□□□ -2.27
HIT1	YJR055W	ERV29	P53337	310 aa		0.88	□□□□□ -2.27

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