RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNAB2	Q13303	367 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	C12orf60	Q5U649	245 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL7B	Q6UX53	244 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PRR7	Q8TB68	274 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	USP33	Q8TEY7	942 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	EXOC4	Q96A65	974 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM87B	Q96K49	555 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	OSMR	Q99650	979 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A1B0GTW7	788 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	EFS	O43281	561 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	MICAL2	O94851	1124 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PTPN2	P17706	415 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	LSS	P48449	732 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CDR1	P51861	262 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	DNAJC3	Q13217	504 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	MORC3	Q14149	939 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CDH24	Q86UP0	819 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR65	Q8IYL9	337 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC13	Q8NBP0	860 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	RGS22	Q8NE09	1264 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	URGCP	Q8TCY9	931 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP95	Q96GE4	821 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	B3GALT6	Q96L58	329 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR1B	Q9H9Y6	1135 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CHST7	Q9NS84	486 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	MARCH5	Q9NX47	278 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	COL20A1	Q9P218	1284 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	PTPRD	P23468	1912 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	INSRR	P14616	1297 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	ACADVL	P49748	655 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	ASIC1	P78348	528 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	PLCB2	Q00722	1185 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	AMPD2	Q01433	879 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	NEDD9	Q14511	834 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	CRY1	Q16526	586 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	USP41	Q3LFD5	358 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	NAGS	Q8N159	534 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	PGBD3	Q8N328	593 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	CORO1B	Q9BR76	489 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	PXMP2	Q9NR77	195 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0G2JK05	382 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	DPYSL4	O14531	572 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	GRID2	O43424	1007 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	DDHD2	O94830	711 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	PSEN1	P49768	467 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	PLCB4	Q15147	1175 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC96	Q2M329	555 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	LONRF3	Q496Y0	759 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	HMGB4	Q8WW32	186 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	LPP	Q93052	612 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	DACT1	Q9NYF0	836 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM221A	A4D161	298 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF212B	A8MTL3	300 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	CBX4	O00257	560 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	MT-CO3	P00414	261 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC16A2	P36021	539 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SNAP23-223	ENST00000627440	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26

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