RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 NXPH1P58417 271 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 NOMO3P69849 1222 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 ITIH3Q06033 890 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 NOMO1Q15155 1222 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 NOMO2Q5JPE7 1267 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 PXDC1Q5TGL8 231 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF66Q6ZN08 573 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 C11orf74Q86VG3 221 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 PQLC1Q8N2U9 271 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q8NA96 180 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 SMC1BQ8NDV3 1235 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC30A5Q8TAD4 765 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 LPIN2Q92539 896 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 PBKQ96KB5 322 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM79Q9BSE2 394 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 VPS16Q9H269 839 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 MS4A5Q9H3V2 200 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 SERGEFQ9UGK8 458 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 TARM1B6A8C7 271 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 TUBB4AP04350 444 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 KCNA2P16389 499 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 CCT8P50990 548 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 NEK4P51957 841 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 FPGSQ05932 587 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 DLK2Q6UY11 383 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q6ZVL8 140 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 RAX2Q96IS3 184 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 NELL2Q99435 816 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRDM12Q9H4Q4 367 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU2-38P-201ENST00000410856 WDR27A2RRH5 827 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDHR4A6H8M9 788 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM83GA6ND36 823 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRT86O43790 486 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 ENDOD1O94919 500 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 CYP2D6P10635 497 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 FCER1AP12319 257 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 LSSP48449 732 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF134P52741 427 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLFN5Q08AF3 891 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRT81Q14533 505 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATP2B3Q16720 1220 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 PROSER3Q2NL68 480 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 CEP85Q6P2H3 762 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC2A7Q6PXP3 512 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 CAMKK1Q8N5S9 505 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 TBC1D15Q8TC07 691 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 SNX19Q92543 992 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 MARK4Q96L34 752 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 ALG8Q9BVK2 526 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 KLC4Q9NSK0 619 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC23A1Q9UHI7 598 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 ERVV-2B6SEH9 535 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 WNT10BO00744 389 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 SOCS2O14508 198 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 JTBO76095 146 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 EBLN1P0CF75 366 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 PPP3CBP16298 524 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 SCP2P22307 547 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 GATA3P23771 443 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 UGT8Q16880 541 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 NAALADL2Q58DX5 795 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 CT83Q5H943 113 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 PLAC9Q5JTB6 97 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 CEP78Q5JTW2 689 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 SOGA3Q5TF21 947 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 NSMCE1Q8WV22 266 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 ACAP3Q96P50 834 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 PRSS22Q9GZN4 317 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 GSTO2Q9H4Y5 243 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 SPTLC3Q9NUV7 552 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM260Q9NX78 707 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 DPP7Q9UHL4 492 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR32O75388 356 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU2-38P-201ENST00000410856 HAUS5O94927 633 aa2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms