RNA–Protein interactions for RNA: YML061C

PIF1, Transcript of DNA helicase, potent G-quadruplex DNA binder/unwinder, yeast

Gene PIF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PIF1	YML061C	NRG1	Q03125	231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	MRX8	Q05473	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	ATP16	Q12165	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	ADH7	P25377	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	STP22	P25604	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	LAC1	P28496	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	MRP17	P28778	131 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	AGA2	P32781	87 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	UPS2	P35200	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	MIC12	P38341	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	RSM27	P53305	110 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	STP4	Q07351	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	MLF3	P32047	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	ECM25	P32525	599 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YKL071W	P36086	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YNL194C	P40169	301 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	UBP8	P50102	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YLR460C	P54007	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	IZH1	Q03419	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TRA1	P38811	3744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	CMC1	P36064	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	PTC7	P38797	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	UIP3	P39547	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	MOG1	P47123	218 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	BXI1	P48558	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	HXT2	P23585	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	ICS2	P38284	255 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	DER1	P38307	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	PEX30	Q06169	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	ENB1	Q08299	606 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YOR343C	Q12484	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	QCR2	P07257	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	URA6	P15700	204 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	SPO7	P18410	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	SEC22	P22214	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YPS1	P32329	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	COS8	P38723	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YIL067C	P40514	678 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	POP6	P53218	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	DYN2	Q02647	92 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	CPT1	P17898	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	NUP1	P20676	1076 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	PAC2	P39937	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	RMD6	P39975	231 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YIL086C	P40503	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YIP5	P53108	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	SNO1	Q03144	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	DPP1	Q05521	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	RRT7	Q07829	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	ATP10	P18496	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	GPX1	P36014	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YKR041W	P36134	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	YJL193W	P39542	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	DLS1	P40366	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	BUD8	P41698	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	SNN1	P48232	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	PHB2	P50085	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	RLM1	Q12224	676 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	FYV7	Q12247	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	UBA3	Q99344	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PIF1	YML061C	POP8	P38208	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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