RNA–Protein interactions for RNA: YLR008C

PAM18, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM18, Length 507 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM18	YLR008C	PGD1	P40356	397 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MAM33	P40513	266 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	CDC1	P40986	491 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	EGT2	P42835	1041 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YJR015W	P47090	510 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	UBC13	P52490	153 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	COG7	P53195	279 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	VHT1	P53241	593 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	BOR1	P53838	576 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SUR7	P54003	302 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	DID2	P69771	204 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YMR010W	Q03687	405 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	TSA2	Q04120	196 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SDH7	Q04401	133 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YDR278C	Q05612	105 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YLR012C	Q07927	99 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YPR202W	Q08993	238 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YLR049C	Q12110	428 aa		3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	COX5A	P00424	153 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RAD10	P06838	210 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ATR1	P13090	542 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SPS100	P13130	326 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YCR006C	P25350	157 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	BUB3	P26449	341 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	FRE2	P36033	711 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RIM2	P38127	377 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	GPX2	P38143	162 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	GEP4	P38812	185 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MST28	P39552	234 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RFC2	P40348	353 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YIL067C	P40514	678 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YIP1	P53039	248 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	TPN1	P53099	579 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PRM8	P53174	237 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SWS2	P53937	143 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SAE3	P89114	91 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	OSH6	Q02201	448 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RAV2	Q03956	351 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YDR124W	Q04608	324 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YMR320W	Q04897	101 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	COQ10	Q08058	207 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	IES4	Q08561	116 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ERV2	Q12284	196 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	TRM10	Q12400	293 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	REP1	P03871	373 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	CYC3	P06182	269 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	DDI2	P0CH63	225 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	DDI3	P0CH64	225 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	GCN3	P14741	305 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	LSB5	P25369	354 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MRPL9	P31334	269 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PHA2	P32452	334 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	TIR2	P33890	251 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	LAG1	P38703	411 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	EXO1	P39875	702 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YIL169C	P40442	995 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	SER33	P40510	469 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MOB2	P43563	287 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	FAR7	P43592	221 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	BIR1	P47134	954 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MCM22	P47167	239 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	BXI1	P48558	297 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	COQ5	P49017	307 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	UFD1	P53044	361 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	FRE4	P53746	719 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	HCH1	P53834	153 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YKR005C	Q02203	525 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	RSC9	Q03124	581 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	BET5	Q03630	159 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	ATP16	Q12165	160 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	PSF1	Q12488	208 aa		3.41	□□□□□ -1.86
PAM18	YLR008C	MDM10	P18409	493 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	COQ3	P27680	312 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	SRL3	P36167	246 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	MRPL24	P36525	258 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	ARN1	P38731	627 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	TRR2	P38816	342 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	PEP8	P40335	379 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	YIL054W	P40524	105 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	HAC1	P41546	238 aa		3.4	□□□□□ -1.87
PAM18	YLR008C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87

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