RNA–Protein interactions for RNA: YGR019W

UGA1, Transcript of Gamma-aminobutyrate (GABA) transaminase, yeast

Gene UGA1, Length 1,416 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UGA1	YGR019W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	GGC1	P38988	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YFR020W	P43600	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	MOG1	P47123	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	PHB2	P50085	310 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	FHN1	P53279	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	ATG4	P53867	494 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	SNO1	Q03144	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	BSP1	Q06604	576 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	SCP1	Q08873	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	TPO4	Q12256	659 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	TRM13	Q12383	476 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	CPR4	P25334	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	SFK1	P35735	353 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	RRN10	P38204	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	SHG1	P38337	142 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	GET2	P40056	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	PGD1	P40356	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YPS6	P40583	537 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	PMT6	P42934	759 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YFR057W	P43625	151 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	TOS2	P50078	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	SWC4	P53201	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	ARL3	Q02804	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	SUT2	Q12286	268 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	FSH3	Q99369	266 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	PHO2	P07269	559 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	CNE1	P27825	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	IES6	P32617	166 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YEF1	P32622	495 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	GMH1	P36125	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	RIB5	P38145	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	MBB1	P39534	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	APQ12	P40532	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	CIN2	P46670	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YJL016W	P47072	561 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	CDH1	P53197	566 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	VHT1	P53241	593 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	CCE1	Q03702	353 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	CAC2	Q04199	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	PEX30	Q06169	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	ERG4	P25340	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
UGA1	YGR019W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	BNA4	P38169	460 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YIR035C	P40579	254 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	NIF3	P53081	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YGL101W	P53144	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YNR066C	P53752	436 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	TEX1	P53851	422 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	MRPL22	P53881	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	NRK1	P53915	240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	RHO4	Q00246	291 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	DYN2	Q02647	92 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	NRG1	Q03125	231 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	AGC1	Q12482	902 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UGA1	YGR019W	COX9	P07255	59 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	NAM2	P11325	894 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	URA6	P15700	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
UGA1	YGR019W	RMD6	P39975	231 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	RFC2	P40348	353 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	RSM27	P53305	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	NUP53	Q03790	475 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	FCY22	Q12119	530 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UGA1	YGR019W	YPR063C	Q12160	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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