RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559974.5

RABGGTA-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 1,963 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-212ENST00000559974 MARCKSL1P49006 195 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 PEX5P50542 639 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 BIRC3Q13489 604 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 EEPD1Q7L9B9 569 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF677Q86XU0 584 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 PIK3R5Q8WYR1 880 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CD101Q93033 1021 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM167AQ96KS9 214 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 AZI2Q9H6S1 392 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 VNN1O95497 513 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ALDH1A1P00352 501 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 EDN1P05305 212 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 BPIFB4P59827 614 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 LY6KQ17RY6 165 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 LEKR1Q6ZMV7 388 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CD302Q8IX05 232 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 MMP19Q99542 508 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CGRRF1Q99675 332 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 RAB17Q9H0T7 212 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ERVK-5Q9HDB9 667 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM114A2Q9NRY5 505 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa15.49■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 DAPK3O43293 454 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 UNGP13051 313 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CTNNA2P26232 953 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ADORA2AP29274 412 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 COPB2P35606 906 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 DR1Q01658 176 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 TTMPQ5BVD1 217 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 AADACL2Q6P093 401 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ZPBP2Q6X784 338 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 SHCBP1Q8NEM2 672 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 LRRC45Q96CN5 670 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 NEUROG2Q9H2A3 272 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 MROH8Q9H579 483 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 DNAH12Q6ZR08 3092 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 SPOPO43791 374 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ARIH2O95376 493 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CALCAP01258 141 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CCNA1P78396 465 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 DRP2Q13474 957 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ZSCAN26Q16670 478 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 SPOPLQ6IQ16 392 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CD99L2Q8TCZ2 262 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ARL8AQ96BM9 186 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 BTBD6Q96KE9 485 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 GABRQQ9UN88 632 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 EVPLQ92817 2033 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 FAM187AA6NFU0 413 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 PHF2O75151 1096 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 RPS6KA5O75582 802 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 KRT14P02533 472 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ACO1P21399 889 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 EFNA5P52803 228 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CUL2Q13617 745 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 IER5Q5VY09 327 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 GLG1Q92896 1179 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 TRIM11Q96F44 468 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 GPR20Q99678 358 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 TRIM51Q9BSJ1 452 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 WBP1LQ9NX94 342 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ANK1P16157 1881 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 GPR25O00155 361 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CLDN3O15551 220 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 GAS2O43903 313 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 LGR5O75473 907 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 MYBL1P10243 752 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 PSMC4P43686 418 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 MCOLN2Q8IZK6 566 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 NPLOC4Q8TAT6 608 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 TCP11Q8WWU5 503 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 CCDC113Q9H0I3 377 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-212ENST00000559974 DPH5Q9H2P9 285 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms