RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MID2Q9UJV3 735 aa17.52■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP17.52■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA8CPA6NN73 597 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNN4O15554 427 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRAK1P51617 712 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2orf69Q8N8R5 385 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CBWD1Q9BRT8 395 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM253P0C7T8 217 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACTR2P61160 394 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRP10Q7Z4F1 713 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAGLBQ8NCG7 672 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM167BQ9BTA0 163 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPON2Q9BUD6 331 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLG5Q8TDM6 1919 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLC3Q6P597 504 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP2W1Q8TAV3 490 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCOCQ9UIL1 159 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGEF37A1IGU5 675 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELF1P32519 619 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXW10Q5XX13 1052 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT80Q6KB66 452 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL17RBQ9NRM6 502 aa17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A087X0B3 334 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LSP1P33241 339 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COPS2P61201 443 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC29A2Q14542 456 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFHC2Q5JST6 749 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRLQ86TD4 932 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SENP7Q9BQF6 1050 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERP44Q9BS26 406 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNC45AQ9H3U1 944 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP17.5■□□□□ 0.391e-6■■■□□ 15
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDH16O75309 829 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDHA1P08559 390 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PON1P27169 355 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDKAL1Q5VV42 579 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf146Q5VVC0 180 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRN4CLQ8ND94 238 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM161BQ96MY7 647 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJC7Q99615 494 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MKNK1Q9BUB5 465 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFHD1Q9BUP0 239 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FUT8Q9BYC5 575 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC1A1P43005 524 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLA2G4AP47712 749 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF19Q2TAC6 998 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP8B3O60423 1300 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA8OA6NCC3 632 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA8NF8WBI6 632 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMC6P62333 389 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPPQ6IPU0 288 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MDM1Q8TC05 714 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEU2Q9Y3R4 380 aa17.5■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NVLO15381 856 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AKAP3O75969 853 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ICE2Q659A1 982 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYFIP2Q96F07 1278 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCAPGQ9BPX3 1015 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ECT2Q9H8V3 914 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCND2Q9NZV8 630 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNAT1P11488 350 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDR2Q01850 454 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAT4Q14765 748 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXL16Q8N461 479 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC16A10Q8TF71 515 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM4Q9C037 500 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZFATQ9P243 1243 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP3K6O95382 1288 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CTSHP09668 335 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTF2H1P32780 548 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPAT2Q6NUI2 795 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPAINQ86UA6 219 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP17.49■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 27.5
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EPN3Q9H201 632 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM8AQ9HCN3 771 aa17.49■□□□□ 0.39
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRC1P22897 1456 aa17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90 ms