RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RFX1P22670 979 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBA7P41226 1012 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEZ6Q53EL9 994 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR152Q8TDT2 470 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D32Q96NH3 1257 aa28.61■■■□□ 2.17
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GFRA3O60609 400 aa28.6■■■□□ 2.17
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC10A6Q3KNW5 377 aa28.6■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC8B1Q6J4K2 584 aa28.6■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGF13Q92913 245 aa28.6■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BICD1Q96G01 975 aa28.6■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa28.6■■■□□ 2.17
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPBP1Q86WP2 473 aa28.59■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC105Q8IYK2 499 aa28.59■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF461Q8TAF7 563 aa28.59■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITFG1Q8TB96 612 aa28.59■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FGF14Q92915 247 aa28.59■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa28.59■■■□□ 2.17
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTSS1LQ765P7 747 aa28.58■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAUS6Q7Z4H7 955 aa28.58■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REEP2Q9BRK0 252 aa28.58■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNH3Q9ULD8 1083 aa28.58■■■□□ 2.17
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PROB1E7EW31 1015 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLTAP09496 248 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELF1P32519 619 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARPP19P56211 112 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DTWD2Q8NBA8 298 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUSD3Q96L08 255 aa28.57■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D17Q9HA65 648 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF3Q9NR81 526 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa28.57■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR27A2RRH5 827 aa28.56■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D4O60343 1298 aa28.56■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABLIM3O94929 683 aa28.56■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NBL1P41271 181 aa28.56■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RASSF8Q8NHQ8 419 aa28.56■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNN1Q92952 543 aa28.56■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAPLN2Q9GZV7 340 aa28.56■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCP2P22307 547 aa28.55■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIG4P49917 911 aa28.55■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYCT1Q8N699 235 aa28.55■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC15Q8TF66 581 aa28.55■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa28.55■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXL5Q9UKA1 691 aa28.55■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF37A1IGU5 675 aa28.54■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATF2P15336 505 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLCG1P19174 1290 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIN1Q05586 938 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPAG1Q07617 926 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MCM6Q14566 821 aa28.54■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KYAT1Q16773 422 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTXN3Q4LDR2 81 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa28.54■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APPL2Q8NEU8 664 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ING5Q8WYH8 240 aa28.54■■■□□ 2.16
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHOP08100 348 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPN2P17706 415 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF131P52739 623 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPC5P78333 572 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KARSQ15046 597 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANGPT1Q15389 498 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPGS2Q68CL5 300 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF280DQ6N043 979 aa28.53■■■□□ 2.16
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCEAL8Q8IYN2 117 aa28.53■■■□□ 2.16
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