RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SH2D3AQ9BRG2 576 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 XYLT2Q9H1B5 865 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ARSEP51690 589 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PRELPP51888 382 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MAMLD1Q13495 774 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF534Q76KX8 674 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GATA6Q92908 595 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ELMO3Q96BJ8 720 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0G2JMZ2 1700 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPN14A8MX76 684 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP26A1O43174 497 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJC6O75061 913 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 EGFRP00533 1210 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DLDP09622 509 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ITIH2P19823 946 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CNGA1P29973 690 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SLCO1A2P46721 670 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 BTKQ06187 659 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNG2Q16589 344 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GRIPAP1Q4V328 841 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ARTNQ5T4W7 220 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO11Q86XK2 927 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 BANPQ8N9N5 519 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PDCD2LQ9BRP1 358 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB17Q9H0T7 212 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ACSS3Q9H6R3 686 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RXFP1Q9HBX9 757 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PLA2G4CQ9UP65 541 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 IL4RP24394 825 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NPTX2P47972 431 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 C6orf118Q5T5N4 469 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 FKBP1CQ5VVH2 108 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 VSIG10LQ86VR7 867 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TREML1Q86YW5 311 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 C7orf31Q8N865 590 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MXRA8Q9BRK3 442 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MCMBPQ9BTE3 642 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CD2APQ9Y5K6 639 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 E5RJQ4 531 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 C2CD2LO14523 706 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 BUD23O43709 281 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CALB2P22676 271 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGA8P53708 1063 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3TC2Q8TF17 1288 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SKA1Q96BD8 255 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 C20orf27Q9GZN8 174 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 WNT8AQ9H1J5 351 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP73A6NFT4 308 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 KLF11O14901 512 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 UPP2O95045 317 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEA3P43357 314 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PICALMQ13492 652 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RASA3Q14644 834 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 C2CD6Q53TS8 623 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 OTOAQ7RTW8 1153 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC7BQ86TV6 843 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 WNK4Q96J92 1243 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf72Q96LT7 481 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NACC1Q96RE7 527 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CYTH4Q9UIA0 394 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PLS3P13797 630 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GBP1P32455 592 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MXI1P50539 228 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GDF10P55107 478 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 COPS2P61201 443 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PGM2L1Q6PCE3 622 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM178BQ8IXR5 827 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF2BQ8N4N8 673 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 LMBR1Q8WVP7 490 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TEKT1Q969V4 418 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RTP4Q96DX8 246 aa3.87□□□□□ -1.79
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