RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	CEP120	Q8N960	986 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	BAP1	Q92560	729 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	TAF4B	Q92750	862 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TRAF4-208	ENST00000469529	INPPL1	O15357	1258 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	EOMES	O95936	686 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CXCL10	P02778	98 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CTSH	P09668	335 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CYP3A5	P20815	502 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CD52	P31358	61 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNJ6	P48051	423 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	KLK7	P49862	253 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	GCNT1	Q02742	428 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TLE2	Q04725	743 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	GPNMB	Q14956	572 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PTPN21	Q16825	1174 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SEZ6	Q53EL9	994 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM192	Q8IY95	271 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	APBB2	Q92870	758 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	RGS18	Q9NS28	235 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	GCNT4	Q9P109	453 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TBX21	Q9UL17	535 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	IPP	Q9Y573	584 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PTPRJ	Q12913	1337 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	EPHB6	O15197	1021 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	VNN1	O95497	513 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CXCL8	P10145	99 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	GHR	P10912	638 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ATIC	P31939	592 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	JAM2	P57087	298 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM139	Q8IV31	216 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SNX27	Q96L92	541 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SNTG2	Q9NY99	539 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	NRDC	O43847	1150 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	HLA-DRA	P01903	254 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	TNNC2	P02585	160 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	RFC2	P35250	354 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	OSTN	P61366	133 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR44	Q5JSH3	913 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	PGBD4	Q96DM1	585 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TRAF4-208	ENST00000469529	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms