RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 REEP2Q9BRK0 252 aa29.19■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa29.19■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa29.19■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 LIMD1Q9UGP4 676 aa29.19■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 FBXW11Q9UKB1 542 aa29.19■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 CLUHO75153 1309 aa29.19■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 CLDN3O15551 220 aa29.18■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 RFPL2O75678 378 aa29.18■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 FAM13AO94988 1023 aa29.18■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 SYT1P21579 422 aa29.18■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 ZNF131P52739 623 aa29.18■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa29.18■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 PRRX2Q99811 253 aa29.18■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 PARVGQ9HBI0 331 aa29.18■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa29.17■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 ZMYND10O75800 440 aa29.17■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 KYAT1Q16773 422 aa29.17■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 HAUS6Q7Z4H7 955 aa29.17■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 FEZF2Q8TBJ5 459 aa29.17■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 BICD1Q96G01 975 aa29.17■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 MTRRQ9UBK8 725 aa29.17■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP29.16■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 RESTQ13127 1097 aa29.16■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 PTPAQ15257 358 aa29.16■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 ANKS3Q6ZW76 656 aa29.16■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 RTL10Q7L3V2 364 aa29.16■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 IGSF9Q9P2J2 1179 aa29.16■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 BACE2Q9Y5Z0 518 aa29.16■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 C3orf58Q8NDZ4 430 aa29.14■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 EPS15L1Q9UBC2 864 aa29.14■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 TBX20Q9UMR3 447 aa29.14■■■□□ 2.26
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ODC1-204ENST00000446285 KMT2EQ8IZD2 1858 aa29.13■■■□□ 2.25
ODC1-204ENST00000446285 K7ENM7 598 aa29.13■■■□□ 2.25
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ODC1-204ENST00000446285 LIG4P49917 911 aa29.13■■■□□ 2.25
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ODC1-204ENST00000446285 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
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ODC1-204ENST00000446285 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
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ODC1-204ENST00000446285 TSPAN18Q96SJ8 248 aa29.12■■■□□ 2.25
ODC1-204ENST00000446285 NUB1Q9Y5A7 615 aa29.12■■■□□ 2.25
ODC1-204ENST00000446285 WDFY4Q6ZS81 3184 aa29.11■■■□□ 2.25
ODC1-204ENST00000446285 XYLBO75191 536 aa29.11■■■□□ 2.25
ODC1-204ENST00000446285 C8AP07357 584 aa29.11■■■□□ 2.25
ODC1-204ENST00000446285 OR1D2P34982 312 aa29.11■■■□□ 2.25
ODC1-204ENST00000446285 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
ODC1-204ENST00000446285 EPSTI1Q96J88 318 aa29.11■■■□□ 2.25
ODC1-204ENST00000446285 KCNK12Q9HB15 430 aa29.11■■■□□ 2.25
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