RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 POTEJP0CG39 1038 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 TPBGLP0DKB5 382 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 NQO1P15559 274 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CRKP46108 304 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SNAP25P60880 206 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC181Q5TID7 509 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF43Q68DV7 783 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 DPF3Q92784 378 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 BTBD6Q96KE9 485 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 C17orf75Q9HAS0 396 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 KRT82Q9NSB4 513 aa3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC172P0C7W6 258 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GCLMP48507 274 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 OCRLQ01968 901 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PPARDQ03181 441 aa3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP61Q8NHU2 1237 aa3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 SHKBP1Q8TBC3 707 aa3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 TSG101Q99816 390 aa3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM191BP0C7N4 346 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCB4P21439 1286 aa3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 CRYMQ14894 314 aa3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 PLA2G4FQ68DD2 849 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SEPT14Q6ZU15 432 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SUPT20HQ8NEM7 779 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 PI4KBQ9UBF8 816 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ARID2Q68CP9 1835 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0B4J269 797 aa3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN3O15551 220 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 WFS1O76024 890 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PROSCO94903 275 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GGPS1O95749 300 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GH2P01242 217 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 BMP3P12645 472 aa3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM31Q9BZY9 425 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 FETUBQ9UGM5 382 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEA6P43360 314 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GPC5P78333 572 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SKIDA1Q1XH10 827 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 HAUS6Q7Z4H7 955 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 HSPBP1Q9NZL4 362 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP83Q9Y592 693 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 SMAPO00193 183 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 GDF11O95390 407 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PAX7P23759 505 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MNAT1P51948 309 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 PDK4Q16654 411 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ODR4Q5SWX8 454 aa3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 CLNKQ7Z7G1 428 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 C4orf19Q8IY42 314 aa3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 XXYLT1Q8NBI6 393 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1586Q9HCI6 787 aa3.88□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MYH11P35749 1972 aa3.87□□□□□ -1.79
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PGGT1B-203ENST00000419445 SLMAPQ14BN4 828 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 LONRF1Q17RB8 773 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 RABGAP1LQ5R372 815 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC38Q5VT99 294 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC63Q8NA47 563 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC197Q8NCU1 140 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 ASAP3Q8TDY4 903 aa3.87□□□□□ -1.79
PGGT1B-203ENST00000419445 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP3.87□□□□□ -1.791e-5■□□□□ 10.3
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