RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.52■■□□□ 1.36
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR25O00155 361 aa23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHACTR2O75167 634 aa23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PALMO75781 387 aa23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GZMAP12544 262 aa23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CHRNB2P17787 502 aa23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSMC4P43686 418 aa23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE6CP51160 858 aa23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CUL2Q13617 745 aa23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PALB2Q86YC2 1186 aa23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA1Q92805 767 aa23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ISCUQ9H1K1 167 aa23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD62A6NC57 917 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSPAN1O60635 241 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ASS1P00966 412 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLTAP09496 248 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYBAP13498 195 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCP1P17987 556 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOP14P78316 857 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDR2Q01850 454 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.355e-6■■■■□ 24.2
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CEP120Q8N960 986 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCLT1Q96NL6 688 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TLR10Q9BXR5 811 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTMR12Q9C0I1 747 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRPV1Q8NER1 839 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RFFLQ8WZ73 363 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RABGGTAQ92696 567 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARID3AQ99856 593 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IMPG2Q9BZV3 1241 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNTN6Q9UQ52 1028 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HYOU1Q9Y4L1 999 aa23.5■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1B0GUA9 196 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPR32O75388 356 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERLIN2O94905 339 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYL3P08590 195 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTAGE8P0CG41 777 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACO1P21399 889 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HOXC8P31273 242 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BPIFB4P59827 614 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FMO1Q01740 532 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPOPLQ6IQ16 392 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNAAF5Q86Y56 855 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC57Q8N9N7 239 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ELMO3Q96BJ8 720 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KPNA6O60684 536 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRGAP2O75044 1071 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RTN2O75298 545 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TOMM70O94826 608 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP2C9P11712 490 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRT5P13647 590 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PURAQ00577 322 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BEX3Q00994 111 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCEAL1Q15170 157 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MEI1Q5TIA1 1274 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF677Q86XU0 584 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EFCAB13Q8IY85 973 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPCN2Q8NHX9 752 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIB2Q92519 343 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUB1Q9Y5A7 615 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CITO14578 2027 aa23.48■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM191BP0C7N4 346 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAG3L1P0CL83 205 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CXCL8P10145 99 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM212AQ96EL1 285 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPB2Q96IY4 423 aa23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OSBPL9Q96SU4 736 aa23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms