RNA–Protein interactions for RNA: YBL050W

SEC17, Transcript of Alpha-SNAP cochaperone, yeast

Gene SEC17, Length 879 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SEC17	YBL050W	BUD32	P53323	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	TRS23	Q03784	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	IRC10	Q08118	586 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	HRT3	Q12347	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	GEP5	Q12393	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	TFC7	Q12415	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	CDC7	P06243	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	DDI2	P0CH63	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	DDI3	P0CH64	225 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	ERG4	P25340	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	PEX34	P25584	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	CDC50	P25656	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	MRP49	P32388	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	HYM1	P32464	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	SFC1	P33303	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	OMA1	P36163	345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	SCO2	P38072	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YHK8	P38776	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	GEP4	P38812	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	AIM2	P39721	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	DFG10	P40526	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	HAC1	P41546	238 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	GLC8	P41818	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YJR015W	P47090	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	BIR1	P47134	954 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	BET5	Q03630	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	GPI17	Q04080	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	TAF9	Q05027	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	AIM39	Q08223	395 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	POM152	P39685	1337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	DRS2	P39524	1355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	COX5A	P00424	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	BAR1	P12630	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	HCM1	P25364	564 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	LSB5	P25369	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	TOD6	P34219	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YBR096W	P38256	230 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YPC1	P38298	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YPT31	P38555	223 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	SPL2	P38839	148 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	AYR1	P40471	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	IKS1	P47042	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	RFM1	Q12192	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	ORT1	Q12375	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	LAS17	Q12446	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	PHA2	P32452	334 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	AEP1	P32493	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YKL097C	P34245	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
SEC17	YBL050W	PHD1	P36093	366 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YBR137W	P38276	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	CHL4	P38907	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YIL169C	P40442	995 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YNL320W	P42840	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	MIC19	P43594	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	COQ5	P49017	307 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YIP1	P53039	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YPS5	P53057	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	HHT1	P61830	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	HSK3	P69852	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	RSC9	Q03124	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	STE4	P18851	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	PHO13	P19881	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	ATG22	P25568	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	CPR3	P25719	182 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	BUB3	P26449	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	SNC1	P31109	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	TIR2	P33890	251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YBR220C	P38318	560 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	DOG2	P38773	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	DOG1	P38774	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YIL029C	P40538	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	FMN1	Q03778	218 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	GMC1	Q04399	608 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	LIP2	Q06005	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	ATG39	Q06159	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	PEX30	Q06169	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SEC17	YBL050W	GAT3	Q07928	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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