RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 KIF4AO95239 1232 aa29.28■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 MCF2P10911 925 aa29.28■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 SP100P23497 879 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 LONP1P36776 959 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 STRN3Q13033 797 aa29.28■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 PAAF1Q9BRP4 392 aa29.28■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 TTPALQ9BTX7 342 aa29.28■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 MYO10Q9HD67 2058 aa29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 CITO14578 2027 aa29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 SLC16A4O15374 487 aa29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 BRD1O95696 1058 aa29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 SCP2P22307 547 aa29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 PROZP22891 400 aa29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 KANK3Q6NY19 840 aa29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 MPZL3Q6UWV2 235 aa29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 OTOP3Q7RTS5 596 aa29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 TAS1R3Q7RTX0 852 aa29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 RABGGTAQ92696 567 aa29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
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ODC1-204ENST00000446285 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
ODC1-204ENST00000446285 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 PAPLNO95428 1278 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 MTMR3Q13615 1198 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 XKR4Q5GH76 650 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 UBALD2Q8IYN6 164 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 PIK3R5Q8WYR1 880 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 KCNN1Q92952 543 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 B3GALT6Q96L58 329 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 PLIN2Q99541 437 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 TCHPQ9BT92 498 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 BACH2Q9BYV9 841 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 SLC38A7Q9NVC3 462 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 CACNG4Q9UBN1 327 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 ODF2LQ9ULJ1 636 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 SORCS3Q9UPU3 1222 aa29.26■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 SFI1A8K8P3 1242 aa29.25■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 RTP2Q5QGT7 225 aa29.25■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 FAM171A1Q5VUB5 890 aa29.25■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa29.25■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 ZPBP2Q6X784 338 aa29.25■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa29.25■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 CXCL16Q9H2A7 254 aa29.25■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa29.25■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 TGM5O43548 720 aa29.24■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 TOM1L1O75674 476 aa29.24■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 MAPTP10636 758 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa29.24■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 HASPINQ8TF76 798 aa29.24■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 STAMQ92783 540 aa29.24■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 PBXIP1Q96AQ6 731 aa29.24■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 ACAP3Q96P50 834 aa29.24■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa29.23■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa29.23■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 GLRA4Q5JXX5 417 aa29.23■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 LILRA6Q6PI73 481 aa29.23■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 ALKAL1Q6UXT8 129 aa29.23■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 PALB2Q86YC2 1186 aa29.23■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 CEP120Q8N960 986 aa29.23■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 KREMEN2Q8NCW0 462 aa29.23■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 RASSF8Q8NHQ8 419 aa29.23■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa29.23■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 ABLIM1O14639 778 aa29.22■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 TRAPPC3O43617 180 aa29.22■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 B3GAT3O94766 335 aa29.22■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 PSMD5Q16401 504 aa29.22■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
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ODC1-204ENST00000446285 SNX27Q96L92 541 aa29.22■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 VWA8A3KMH1 1905 aa29.22■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 KCNE1P15382 129 aa29.21■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 NCKAP1LP55160 1127 aa29.21■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP29.21■■■□□ 2.271e-323■■□□□ 13
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ODC1-204ENST00000446285 ARSHQ5FYA8 562 aa29.21■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 CEP57Q86XR8 500 aa29.21■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 ASIC4Q96FT7 647 aa29.21■■■□□ 2.27
ODC1-204ENST00000446285 RPL17P18621 184 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 FGFR3P22607 806 aa29.2■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 ABCD1P33897 745 aa29.2■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 CLCNKBP51801 687 aa29.2■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 OSTNP61366 133 aa29.2■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 GPBP1Q86WP2 473 aa29.2■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 FBXL6Q8N531 539 aa29.2■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 CCSER1Q9C0I3 900 aa29.2■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 CNTN3Q9P232 1028 aa29.2■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 PLCG1P19174 1290 aa29.19■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 GLYCTKQ8IVS8 523 aa29.19■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 RAD54LQ92698 747 aa29.19■■■□□ 2.26
ODC1-204ENST00000446285 CLSTN3Q9BQT9 956 aa29.19■■■□□ 2.26
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