RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POU5F1BQ06416 359 aa18.39■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TFDP1Q14186 410 aa18.39■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.39■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPEM1Q8N4L4 309 aa18.39■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBCKQ8TEA7 893 aa18.39■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP295Q9C0D2 2601 aa18.39■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 P4HBP07237 508 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR1D2P34982 312 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FNTBP49356 437 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SATB1Q01826 763 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EMC2Q15006 297 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC27A1Q6PCB7 646 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP68Q76N32 757 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ETNPPLQ8TBG4 499 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HASPINQ8TF76 798 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCEANC2Q96MN5 208 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PARP2Q9UGN5 583 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIAS3Q9Y6X2 628 aa18.38■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAM12O43184 909 aa18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF4AO95239 1232 aa18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPN2P17706 415 aa18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC32Q14392 662 aa18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC5A9Q2M3M2 681 aa18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MOXD1Q6UVY6 613 aa18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP4K3Q8IVH8 894 aa18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MSANTD3Q96H12 275 aa18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTRQ99707 1265 aa18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PAAF1Q9BRP4 392 aa18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANO2Q9NQ90 1003 aa18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLK14Q9P0G3 267 aa18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF197O14709 1029 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MICAL2O94851 1124 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TDP2O95551 362 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF806P0C7X5 589 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHRNB1P11230 501 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEBPBP17676 345 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMC3P17980 439 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FCARP24071 287 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FGD1P98174 961 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPIRE1Q08AE8 756 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP2R5CQ13362 524 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRM2Q14416 872 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C4orf19Q8IY42 314 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOXL4Q96JB6 756 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SH3GLB2Q9NR46 395 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTRRQ9UBK8 725 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa18.36■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CASTOR2A6NHX0 329 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPTXRO95502 500 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRG1P02750 347 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YWHABP31946 246 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NLRP5P59047 1200 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MBTD1Q05BQ5 628 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTGDRQ13258 359 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AMHR2Q16671 573 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM78AQ5JUQ0 283 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CACNG4Q9UBN1 327 aa18.35■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FRYQ5TBA9 3013 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GUA9 196 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EML1O00423 815 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNK5O95279 499 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 THP07101 528 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GDI1P31150 447 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXA6P31267 233 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 XKR9Q5GH70 373 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STPG1Q5TH74 334 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASB16Q96NS5 453 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDY1Q9Y6F8 540 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 F5P12259 2224 aa18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOTCH4Q99466 2003 aa18.33■□□□□ 0.53
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ARHGEF37A1IGU5 675 aa18.33■□□□□ 0.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 K7ESF4 209 aa18.33■□□□□ 0.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF263O14978 683 aa18.33■□□□□ 0.52
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms