RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 RPS6KC1Q96S38 1066 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 AZI2Q9H6S1 392 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ANAPC7Q9UJX3 599 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 RLFQ13129 1914 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ARID2Q68CP9 1835 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 FAM187AA6NFU0 413 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 MAPK13O15264 365 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 RRM1P23921 792 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 BIRC3Q13489 604 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CCDC38Q502W7 563 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 GTF3C4Q9UKN8 822 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 GJA3Q9Y6H8 435 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 UMODL1Q5DID0 1318 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 MROH7Q68CQ1 1323 aa16.7■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 TRAPPC3O43617 180 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 MTA2O94776 668 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 FAM107AO95990 144 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ATP4AP20648 1035 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 SFNP31947 248 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CHRNA3P32297 505 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 TCEAL1Q15170 157 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 AGBL2Q5U5Z8 902 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 GPD1LQ8N335 351 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 PPM1EQ8WY54 764 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 TLCD1Q96CP7 247 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 WNT8AQ9H1J5 351 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 PDLIM7Q9NR12 457 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ZNF541Q9H0D2 1346 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 NFKBIEO00221 500 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ERLIN2O94905 339 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CCND2P30279 289 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ACTR2P61160 394 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 SLC20A2Q08357 652 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 PRKG1Q13976 671 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 TTLL13PA6NNM8 815 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 NF2P35240 595 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CHKAP35790 457 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 BACE1P56817 501 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 WRNIP1Q96S55 665 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 HEMGNQ9BXL5 484 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CYP26B1Q9NR63 512 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 MYPNQ86TC9 1320 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 GMNCA6NCL1 334 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 PMM2O15305 246 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 VPS41P49754 854 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 IWS1Q96ST2 819 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 AAASQ9NRG9 546 aa16.68■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 VNN1O95497 513 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 RWDD2BP57060 319 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 DENND2CQ68D51 928 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 SAMD3Q8N6K7 520 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ASAP3Q8TDY4 903 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 JDP2Q8WYK2 163 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CAPN7Q9Y6W3 813 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 PTPRAP18433 802 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 TNNI1P19237 187 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 SCP2P22307 547 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 MAPK4P31152 587 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 GJC1P36383 396 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 MCOLN2Q8IZK6 566 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 TMC2Q8TDI7 906 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 KIFAP3Q92845 792 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 KLHL11Q9NVR0 708 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 SLC9A2Q9UBY0 812 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 RASAL2Q9UJF2 1139 aa16.67■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 ZBTB7AO95365 584 aa16.66■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 HLA-DRAP01903 254 aa16.66■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 HARSP12081 509 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
NISCH-202ENST00000420808 CHN1P15882 459 aa16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.3 ms