RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	ITR1	P30605	584 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
CPR4	YCR069W	KRE6	P32486	720 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YEF1	P32622	495 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
CPR4	YCR069W	RSM22	P36056	628 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PAU24	P38155	120 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SLZ1	P40167	298 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YJL055W	P47044	245 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PMT5	P52867	743 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YGL204C	P53089	101 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PET191	Q02772	108 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	TRI1	Q05024	226 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SEI1	Q06058	285 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	RTN2	Q12443	393 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YPR1	Q12458	312 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YOR343C	Q12484	108 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SIR2	P06700	562 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	FUN26	P31381	517 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	HYM1	P32464	399 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	THI2	P38141	450 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	REE1	P40893	198 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	ATG18	P43601	500 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	ECO1	P43605	281 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	RRN9	P53437	365 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	GRX5	Q02784	150 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YDR209C	Q03480	137 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MAK3	Q03503	176 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	BNA7	Q04066	261 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	COX20	Q04935	205 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MRX8	Q05473	314 aa		4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PDE2	P06776	526 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PRB1	P09232	635 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SPS4	P09937	338 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	CAP2	P13517	287 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	CPR3	P25719	182 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	HSP150	P32478	413 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PAU2	P32612	120 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SFK1	P35735	353 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YBR137W	P38276	179 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.03	□□□□□ -1.76	not detected
CPR4	YCR069W	FMC1	P40491	155 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SER2	P42941	309 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	TPN1	P53099	579 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	VOA1	P53262	265 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YNR071C	P53757	342 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SUR7	P54003	302 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	ATG21	Q02887	496 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SDC1	Q03323	175 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	PEX30	Q06169	523 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	SSK1	Q07084	712 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MIM1	Q08176	113 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	MCH4	Q08268	501 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	FRE3	Q08905	711 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	FMP27	Q06179	2628 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CPR4	YCR069W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MET2	P08465	486 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PTC6	P25646	442 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	NAM9	P27929	486 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	ATS1	P31386	333 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MCM10	P32354	571 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SPT10	P35208	640 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	MRPL39	P36533	70 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RTC2	P38279	296 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	OM14	P38325	134 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	QRI7	P43122	407 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	YGR126W	P53274	230 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	GIM3	P53900	129 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	GPI17	Q04080	534 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	PEX10	Q05568	337 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	NNT1	Q05874	261 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CPR4	YCR069W	RCN2	Q12044	265 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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