RNA–Protein interactions for RNA: YBL058W

SHP1, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene SHP1, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHP1	YBL058W	PGA1	P53896	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
SHP1	YBL058W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	TCA17	P32613	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	IES6	P32617	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	HIS6	P40545	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SFH5	P47008	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	GTR1	Q00582	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	OST6	Q03723	332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	GPI17	Q04080	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	DLT1	Q04216	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	MLC2	Q06580	163 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	NAM2	P11325	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	UBC8	P28263	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YOX1	P34161	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	FZO1	P38297	855 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SLM1	P40485	686 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	TIR3	P40552	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	CTK2	P46962	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YJL016W	P47072	561 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	RNH201	P53942	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	HHT1	P61830	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SPC24	Q04477	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	IRC25	Q07951	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YOR352W	Q08816	343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	TGS1	Q12052	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	ENA1	P13587	1091 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	PHO80	P20052	293 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	PUG1	P40100	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	FAR7	P43592	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	RET2	P43621	546 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	BNA1	P47096	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	UFD1	P53044	361 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	MTL1	P53214	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SRL1	Q08673	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	CYC7	P00045	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	KIN28	P06242	306 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YAK1	P14680	807 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SAM35	P14693	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	MRPS28	P21771	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	ACH1	P32316	526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	MRPL6	P32904	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	RRG9	P40156	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	CIN2	P46670	268 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	WSC2	P53832	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YMR226C	Q05016	267 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	MRX8	Q05473	314 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	VIK1	Q12045	647 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SIR2	P06700	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	REC114	P32841	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	IPT1	P38954	527 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	CIN4	P39110	191 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	RMD6	P39975	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	AGE2	P40529	298 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YDL186W	P48568	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	COS10	P52924	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	VOA1	P53262	265 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	SAY1	P53324	424 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	AIM6	Q07716	390 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	FRE3	Q08905	711 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SHP1	YBL058W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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