RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325974.8

CCZ1-201, Transcript of CCZ1 homolog, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCZ1, Length 1,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1-201ENST00000325974 ERO1AQ96HE7 468 aa30.25■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 MYH10P35580 1976 aa30.25■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 FAM189A1O60320 539 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 HARSP12081 509 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 TNNI1P19237 187 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 KIF22Q14807 665 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 NT5C1BQ96P26 610 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 IFT122Q9HBG6 1241 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 AKT3Q9Y243 479 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 PROZP22891 400 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 CTGFP29279 349 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 TUBB2AQ13885 445 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 ZACNQ401N2 412 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 MARCH8Q5T0T0 291 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 ZBTB33Q86T24 672 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 TSC1Q92574 1164 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 TUBB2BQ9BVA1 445 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 MINDY3Q9H8M7 445 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 NAGPAQ9UK23 515 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 NENFQ9UMX5 172 aa30.24■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 OGTO15294 1046 aa30.23■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 GRM1Q13255 1194 aa30.23■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 NAB2Q15742 525 aa30.23■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 ATF7IP2Q5U623 682 aa30.23■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 CGRRF1Q99675 332 aa30.23■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 PTPRHQ9HD43 1115 aa30.23■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 RRN3P2A6NIE6 340 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 MFAP3P55082 362 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 FAM187BQ17R55 369 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 MPZL3Q6UWV2 235 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 BRSK2Q8IWQ3 736 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 PPM1KQ8N3J5 372 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 HELQQ8TDG4 1101 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 KAT5Q92993 513 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 KREMEN1Q96MU8 473 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 SYT11Q9BT88 431 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 A0A087WZ62 844 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 F2P00734 622 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 SEZ6Q53EL9 994 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 TRIM58Q8NG06 486 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 OLIG1Q8TAK6 271 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 Q9Y3F1 56 aa30.22■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 PTPRJQ12913 1337 aa30.21■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 B4GALT5O43286 388 aa30.21■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 TACC1O75410 805 aa30.21■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 VTNP04004 478 aa30.21■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 KIAA0753Q2KHM9 967 aa30.21■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 CYP4F22Q6NT55 531 aa30.21■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 SLC30A5Q8TAD4 765 aa30.21■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 MAP7D2Q96T17 732 aa30.21■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 CDC23Q9UJX2 597 aa30.21■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 ATP8B3O60423 1300 aa30.2■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 ALDH1A1P00352 501 aa30.2■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 FAM84AQ96KN4 292 aa30.2■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 TNFSF13BQ9Y275 285 aa30.2■■■□□ 2.43
CCZ1-201ENST00000325974 IQCF3P0C7M6 154 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 TNFSF9P41273 254 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 FCGRTP55899 365 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 SHC3Q92529 594 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 KAT2BQ92831 832 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 CARD6Q9BX69 1037 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 PACSIN1Q9BY11 444 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 SETD4Q9NVD3 440 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 SALL4Q9UJQ4 1053 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 MOCS3O95396 460 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 CPT1AP50416 773 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 AMPD2Q01433 879 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 TMEM132AQ24JP5 1023 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 ZNF568Q3ZCX4 644 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 FAM71AQ8IYT1 594 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 AP5M1Q9H0R1 490 aa30.19■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 ANO9A1A5B4 782 aa30.18■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 ZEB2O60315 1214 aa30.18■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 HLA-DRAP01903 254 aa30.18■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 BIRC3Q13489 604 aa30.18■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa30.18■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 LRRN4CLQ8ND94 238 aa30.18■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 MNS1Q8NEH6 495 aa30.18■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 LMBR1Q8WVP7 490 aa30.18■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 TATDN2Q93075 761 aa30.18■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 FAM81BQ96LP2 452 aa30.18■■■□□ 2.42
CCZ1-201ENST00000325974 PPP1R16BQ96T49 567 aa30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms