RNA–Protein interactions for RNA: YKL093W

MBR1, Transcript of Protein involved in mitochondrial functions and stress response, yeast

Gene MBR1, Length 1,020 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MBR1	YKL093W	RAD51	P25454	400 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	NDC1	P32500	655 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	PDX3	P38075	228 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	IDP2	P41939	412 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	FMP33	P46998	180 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	SKO1	Q02100	647 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	MEH1	Q02205	184 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	RMI1	Q02685	241 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	IRC15	Q02733	499 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	SPO19	Q03029	223 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	RAF1	Q06891	181 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	SGT1	Q08446	395 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YDL009C	Q12210	107 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	PSF1	Q12488	208 aa		3.15	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	SPT3	P06844	337 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	TFS1	P14306	219 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	CCA1	P21269	546 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	AST1	P35183	429 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	FRE2	P36033	711 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	SLM4	P38247	162 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	BMT2	P38278	337 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	MTC6	P38849	526 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YER188W	P40103	239 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	COA1	P40452	197 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	SAS2	P40963	338 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	CDH1	P53197	566 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	CIK1	Q01649	594 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	DYN3	Q04949	312 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	SPC2	Q04969	178 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	PIN3	Q06449	215 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
MBR1	YKL093W	PSY3	Q12318	242 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	HEM2	P05373	342 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	MRPS28	P21771	286 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	MDH2	P22133	377 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	RHB1	P25378	209 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	ITR2	P30606	609 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	TFC1	P32367	649 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YBR220C	P38318	560 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YHR177W	P38867	453 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YIR020C	P40575	100 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	PCP1	P53259	346 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	GTR2	P53290	341 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YNL140C	P53910	189 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	SLM2	P53955	656 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YDR249C	Q03787	373 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YMR130W	Q04223	302 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	HSP31	Q04432	237 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	AYT1	Q12226	474 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		3.13	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	REP1	P03871	373 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	COS2	P0CX12	379 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	COS3	P0CX13	379 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	MRPL39	P36533	70 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YHL044W	P38727	235 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	SHO1	P40073	367 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YIL029C	P40538	142 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	COS4	P43542	379 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	FMP32	P43557	207 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	NCA3	P46955	337 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	GWT1	P47026	490 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	GET1	P53192	235 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	DSL1	P53847	754 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	MTQ1	P53944	314 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	OCA2	P53949	197 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	MET31	Q03081	177 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	ATG34	Q12292	412 aa		3.12	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	DST1	P07273	309 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	ATR1	P13090	542 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	RPB5	P20434	215 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	CSM1	P25651	190 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	ITR1	P30605	584 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	ATP7	P30902	174 aa		3.11	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
MBR1	YKL093W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 87.6 ms