RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	RAD54L	Q92698	747 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PARVG	Q9HBI0	331 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MTMR6	Q9Y217	621 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	CLIC4	Q9Y696	253 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC16A4	O15374	487 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	TADA2A	O75478	443 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	CTSA	P10619	480 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PLCG1	P19174	1290 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJB1	P25685	340 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	IRS1	P35568	1242 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	DDIT3	P35638	169 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	STAT6	P42226	847 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC11A1	P49279	550 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC12A3	P55017	1021 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAM15	Q13444	863 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	DUSP6	Q16828	381 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ATL3	Q6DD88	541 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PNMA5	Q96PV4	448 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SNTG2	Q9NY99	539 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	HCST	Q9UBK5	93 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	GDA	Q9Y2T3	454 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	HES2	Q9Y543	173 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	TRANK1	O15050	2925 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SFI1	A8K8P3	1242 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246		K7ENM7	598 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	NRP1	O14786	923 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	FSCN2	O14926	492 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PER2	O15055	1255 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SPTLC2	O15270	562 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN3	O15551	220 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAPPC3	O43617	180 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MCF2	P10911	925 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	KLRC2	P26717	231 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	LIG4	P49917	911 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ERVFC1	P60507	584 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	AMPD3	Q01432	767 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	TUSC3	Q13454	348 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC39A14	Q15043	492 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PDXDC1	Q6P996	788 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFP42	Q96MM3	310 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ACAP3	Q96P50	834 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	POLD4	Q9HCU8	107 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	KLK14	Q9P0G3	267 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MYH11	P35749	1972 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	INPPL1	O15357	1258 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAK2	O60296	914 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP6R2	O75170	966 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	TOM1L1	O75674	476 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	RECQL4	O94761	1208 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	DDHD2	O94830	711 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	YEATS4	O95619	227 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SOD2	P04179	222 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ADH1A	P07327	375 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	GLUD2	P49448	558 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	COASY	Q13057	564 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	CAMK1	Q14012	370 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MCM6	Q14566	821 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	CLUL1	Q15846	466 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	USP41	Q3LFD5	358 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ZPBP2	Q6X784	338 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNK18	Q7Z418	384 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		12.42	□□□□□ -0.42

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