RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474539.5

CCNL1-215, Transcript of cyclin L1, human

TSL 1 (best)

Gene CCNL1, Length 4,799 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNL1-215	ENST00000474539	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	MYO1D	O94832	1006 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	MCF2	P10911	925 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	PML	P29590	882 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	ZNF235	Q14590	738 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	MTFR1	Q15390	333 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	ME3	Q16798	604 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	HHAT	Q5VTY9	493 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	RNF149	Q8NC42	400 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	GLMN	Q92990	594 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539		Q9Y3F1	56 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	MEGF6	O75095	1541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	ZNF839	A8K0R7	811 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	DYRK3	O43781	588 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	CDC25B	P30305	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	PSEN1	P49768	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	PSEN2	P49810	448 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	DNA2	P51530	1060 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	STX1B	P61266	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	RCN2	Q14257	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	SOCS7	O14512	581 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	PRKAB2	O43741	272 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	EXTL3	O43909	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	ADH1A	P07327	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	PTGS1	P23219	599 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	RRM1	P23921	792 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	CDC27	P30260	824 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	GRK4	P32298	578 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	GRIK1	P39086	918 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	RANBP1	P43487	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	MAPK8	P45983	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	VAMP7	P51809	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	TPD52	P55327	224 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	DGKZ	Q13574	1117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	TBCC	Q15814	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	CEP72	Q9P209	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	NFASC	O94856	1347 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	ESPN	B1AK53	854 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	CEP104	O60308	925 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	ZBED1	O96006	694 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	CP	P00450	1065 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	RASA1	P20936	1047 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	AP1B1	Q10567	949 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	SCRN1	Q12765	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	PHKG1	Q16816	387 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	UGP2	Q16851	508 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCNL1-215	ENST00000474539	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62

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