RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447046.1

AC004980.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004980.3, Length 365 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004980.3-201ENST00000447046 CIITAP33076 1130 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 DEKP35659 375 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 SREBF1P36956 1147 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 TECP42680 631 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 JAG1P78504 1218 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 PLS1Q14651 629 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 NPY5RQ15761 445 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 GNPTABQ3T906 1256 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 LONRF3Q496Y0 759 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 ARHGEF16Q5VV41 709 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 ANKRD34AQ69YU3 496 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 KCNV1Q6PIU1 500 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 SHC4Q6S5L8 630 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 RNF207Q6ZRF8 634 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 Q6ZS46 218 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 CABP7Q86V35 215 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 ANKRD35Q8N283 1001 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 DNERQ8NFT8 737 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 ARMC5Q96C12 935 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 CLIC6Q96NY7 704 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 IWS1Q96ST2 819 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 SLC9A7Q96T83 725 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 RIT2Q99578 217 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 ANO3Q9BYT9 981 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 CPVLQ9H3G5 476 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 MROH8Q9H579 483 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 ACAD9Q9H845 621 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 FAM86C1Q9NVL1 165 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 GMIPQ9P107 970 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 PCDHB10Q9UN67 800 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 DNM3Q9UQ16 869 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 SCN9AQ15858 1988 aa5.71□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 COL4A5P29400 1685 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 PSME4Q14997 1843 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 FOCADQ5VW36 1801 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 A0A1W2PQH9 124 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 FSD2A1L4K1 749 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 MEIS3P2A8K0S8 358 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 ADM5C9JUS6 153 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 UBE2Q2LH0YL09 131 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 FANCGO15287 622 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 SART1O43290 800 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 STRNO43815 780 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 NRDCO43847 1150 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 NFICP08651 508 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 NME1P15531 152 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 CCND2P30279 289 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 HSD17B4P51659 736 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 CCDC173Q0VFZ6 552 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 SERINC3Q13530 473 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 ADGRE1Q14246 886 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 POSTNQ15063 836 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 STXBP2Q15833 593 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 CEP55Q53EZ4 464 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 PRR16Q569H4 304 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 TMEM201Q5SNT2 666 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 LBX2Q6XYB7 198 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 NLRC3Q7RTR2 1065 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 PLA2G4DQ86XP0 818 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 PDILTQ8N807 584 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 C4orf32Q8N8J7 132 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 IGSF22Q8N9C0 903 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 NEK9Q8TD19 979 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 DHX58Q96C10 678 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 OPTNQ96CV9 577 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 MTMR9Q96QG7 549 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 RMDN3Q96TC7 470 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 BPIFA3Q9BQP9 254 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 PANK2Q9BZ23 570 aa5.7□□□□□ -1.5
AC004980.3-201ENST00000447046 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms