RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306117.5

KCNS1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 4,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-201ENST00000306117 PROM2Q8N271 834 aa16.52■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 MTBPQ96DY7 904 aa16.52■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 P4HA1P13674 534 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 CD58P19256 250 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 CAV1Q03135 178 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 WDR59Q6PJI9 974 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 FAM196AQ6ZSG2 479 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 GLIS3Q8NEA6 775 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ZWILCHQ9H900 591 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 KBTBD4Q9NVX7 518 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ZFATQ9P243 1243 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 CDH16O75309 829 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 HSD17B3P37058 310 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 FAM149B1Q96BN6 582 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 L3MBTL1Q9Y468 752 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ZBED1O96006 694 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 POLR2MP0CAP2 368 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ATP6V1B1P15313 513 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 COPS2P61201 443 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 SLC29A2Q14542 456 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 FSCBQ5H9T9 825 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 IZUMO3Q5VZ72 239 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 GLG1Q92896 1179 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 TCP10L2B9ZVM9 353 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 TJP3O95049 919 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 FOSP01100 380 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 UCHL3P15374 230 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 NMT1P30419 496 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 DAB2P98082 770 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 TMTC4Q5T4D3 741 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 RFFLQ8WZ73 363 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ADAM22Q9P0K1 906 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.51■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 TNNC2P02585 160 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ALAS1P13196 640 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 PRAMEP78395 509 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 IL17AQ16552 155 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ANKS1AQ92625 1134 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 TTC25Q96NG3 672 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ACCSQ96QU6 501 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 VPS11Q9H270 941 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 CPA2P48052 419 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ITKQ08881 620 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 FAF2Q96CS3 445 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 MAD2L2Q9UI95 211 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 RASA1P20936 1047 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 GALCP54803 685 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 KRT17Q04695 432 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 KYNUQ16719 465 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 NBPF20Q3BBV1 942 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 AGR3Q8TD06 166 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 CEP19Q96LK0 163 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 KCNG1Q9UIX4 513 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 PPME1Q9Y570 386 aa16.5■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 CAMTA2O94983 1202 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 NQO1P15559 274 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ATP2B4P23634 1241 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 CD209Q9NNX6 404 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 TNS3Q68CZ2 1445 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 B2RBV5 119 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 GRB10Q13322 594 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 CREG2Q8IUH2 290 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 SYCE1LA8MT33 242 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 UBAP1LF5GYI3 381 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 KCNJ1P48048 391 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 DNAJC3Q13217 504 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 QRICH1Q2TAL8 776 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 KLHL38Q2WGJ6 581 aa16.49■□□□□ 0.23
KCNS1-201ENST00000306117 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms