RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259216.4

CFC1-201, Transcript of cripto, FRL-1, cryptic family 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFC1, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1-201ENST00000259216 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.34■■□□□ 1.17
CFC1-201ENST00000259216 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CFC1-201ENST00000259216 KLK14Q9P0G3 267 aa22.34■■□□□ 1.17
CFC1-201ENST00000259216 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.34■■□□□ 1.17
CFC1-201ENST00000259216 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.34■■□□□ 1.17
CFC1-201ENST00000259216 PTGESO14684 152 aa22.33■■□□□ 1.17
CFC1-201ENST00000259216 GUCY2CP25092 1073 aa22.33■■□□□ 1.17
CFC1-201ENST00000259216 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CFC1-201ENST00000259216 SLC12A3P55017 1021 aa22.33■■□□□ 1.17
CFC1-201ENST00000259216 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.33■■□□□ 1.17
CFC1-201ENST00000259216 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.33■■□□□ 1.17
CFC1-201ENST00000259216 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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CFC1-201ENST00000259216 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
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CFC1-201ENST00000259216 GRIK3Q13003 919 aa22.32■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 RESTQ13127 1097 aa22.32■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 NAB2Q15742 525 aa22.32■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.32■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 HACE1Q8IYU2 909 aa22.32■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
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CFC1-201ENST00000259216 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 CDH22Q9UJ99 828 aa22.32■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.31■■□□□ 1.16
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CFC1-201ENST00000259216 RECQL4O94761 1208 aa22.31■■□□□ 1.16
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CFC1-201ENST00000259216 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
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CFC1-201ENST00000259216 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa22.31■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.31■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 SNTG2Q9NY99 539 aa22.31■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.31■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.31■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 SLC26A4O43511 780 aa22.3■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 BMP15O95972 392 aa22.3■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 SOD2P04179 222 aa22.3■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 PDCP20941 246 aa22.3■■□□□ 1.16
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CFC1-201ENST00000259216 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 ARSHQ5FYA8 562 aa22.3■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.3■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 CABP7Q86V35 215 aa22.3■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.3■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 CASP10Q92851 521 aa22.3■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 DRC1Q96MC2 740 aa22.3■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.3■■□□□ 1.16
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CFC1-201ENST00000259216 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.3■■□□□ 1.16
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CFC1-201ENST00000259216 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.3■■□□□ 1.16
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CFC1-201ENST00000259216 PARP2Q9UGN5 583 aa22.3■■□□□ 1.16
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CFC1-201ENST00000259216 SFI1A8K8P3 1242 aa22.29■■□□□ 1.16
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CFC1-201ENST00000259216 KIAA0319Q5VV43 1072 aa22.29■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.29■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 KLHL5Q96PQ7 755 aa22.29■■□□□ 1.16
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CFC1-201ENST00000259216 MTMR6Q9Y217 621 aa22.29■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 K7ERI5 159 aa22.28■■□□□ 1.16
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CFC1-201ENST00000259216 PROZP22891 400 aa22.28■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.28■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.28■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 RABGGTAQ92696 567 aa22.28■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 KCNN1Q92952 543 aa22.28■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.28■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 APOL5Q9BWW9 433 aa22.28■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.28■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 CDT1Q9H211 546 aa22.28■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 CLIC4Q9Y696 253 aa22.28■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 CCDC169A6NNP5 214 aa22.27■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 GPR37L1O60883 481 aa22.27■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 DSG1Q02413 1049 aa22.27■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.27■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 TUSC3Q13454 348 aa22.27■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 KANK3Q6NY19 840 aa22.27■■□□□ 1.16
CFC1-201ENST00000259216 RNF135Q8IUD6 432 aa22.27■■□□□ 1.16
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