RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551549.1

GCN1-208, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 2

Gene GCN1, Length 258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-208	ENST00000551549	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	MIOS	Q9NXC5	875 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	CDH22	Q9UJ99	828 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		10.8	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	NRP1	O14786	923 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	NPTXR	O95502	500 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	ALDH2	P05091	517 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	CTSA	P10619	480 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	EPCAM	P16422	314 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	AKAP5	P24588	427 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	MLH1	P40692	756 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	PTGDR	Q13258	359 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	KANK3	Q6NY19	840 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	PADI6	Q6TGC4	694 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	CNNM3	Q8NE01	707 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	BSND	Q8WZ55	320 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	CASP10	Q92851	521 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	USP34	Q70CQ2	3546 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		10.79	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549		A0A1B0GUA9	196 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	PRR33	A8MZF0	331 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549		F8W810	466 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	INPPL1	O15357	1258 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	CYP11B2	P19099	503 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	OR1G1	P47890	313 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	SCNN1G	P51170	649 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	PTPN14	Q15678	1187 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	IL17A	Q16552	155 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	TMX3	Q96JJ7	454 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	FZD8	Q9H461	694 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	MARCH5	Q9NX47	278 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	KLK14	Q9P0G3	267 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	USP20	Q9Y2K6	914 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	IRAK3	Q9Y616	596 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		10.77	□□□□□ -0.68
GCN1-208	ENST00000551549	CARNS1	A5YM72	827 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	PP2D1	A8MPX8	630 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	ST18	O60284	1047 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	LILRB3	O75022	631 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	EDN1	P05305	212 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	WEE2	P0C1S8	567 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	LIG1	P18858	919 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	DSC1	Q08554	894 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	PDIA5	Q14554	519 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	MCTP1	Q6DN14	999 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	PARP2	Q9UGN5	583 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	TECTA	O75443	2155 aa		10.77	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		10.76	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	C2CD2L	O14523	706 aa		10.76	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	MUT	P22033	750 aa		10.76	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	KLRC2	P26717	231 aa		10.76	□□□□□ -0.69
GCN1-208	ENST00000551549	CDC25A	P30304	524 aa		10.76	□□□□□ -0.69

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