RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 PRR33A8MZF0 331 aa20.19■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 ST18O60284 1047 aa20.19■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 ALDH2P05091 517 aa20.19■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 PDIA5Q14554 519 aa20.19■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.19■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 PRIMPOLQ96LW4 560 aa20.19■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 RNF39Q9H2S5 420 aa20.19■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 B4GALT5O43286 388 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 POMCP01189 267 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 CYP11B2P19099 503 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 NBR1Q14596 966 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 FAM187BQ17R55 369 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 SLC27A1Q6PCB7 646 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 PADI6Q6TGC4 694 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 MAEAQ7L5Y9 396 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 FZD8Q9H461 694 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 HES2Q9Y543 173 aa20.18■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 NRP1O14786 923 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 DSC1Q08554 894 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 PTGDRQ13258 359 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 HACE1Q8IYU2 909 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 AUTS2Q8WXX7 1259 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 GAD1Q99259 594 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 MUTYHQ9UIF7 546 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 GIT1Q9Y2X7 761 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 KIF3AQ9Y496 699 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 STK24Q9Y6E0 443 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 TECTAO75443 2155 aa20.17■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 LAD1O00515 517 aa20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 CA8P35219 290 aa20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 MLH1P40692 756 aa20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 PTPN14Q15678 1187 aa20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 ECM1Q16610 540 aa20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 BSNDQ8WZ55 320 aa20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 TMX3Q96JJ7 454 aa20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 ZFP42Q96MM3 310 aa20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 MIOSQ9NXC5 875 aa20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa20.16■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 EFEMP2O95967 443 aa20.15■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 PRPHP41219 470 aa20.15■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 ITIH3Q06033 890 aa20.15■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa20.15■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.15■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.15■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.15■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 RAB34Q9BZG1 259 aa20.15■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.15■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.15■□□□□ 0.82
TM2D1-211ENST00000496465 MYO10Q9HD67 2058 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 LILRB3O75022 631 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 NPTXRO95502 500 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 NAMPTP43490 491 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 SCNN1GP51170 649 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 CES5AQ6NT32 575 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 EDAQ92838 391 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 APOL6Q9BWW8 343 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 APOL5Q9BWW9 433 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 MARCH5Q9NX47 278 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 TRIP11Q15643 1979 aa20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 SOD2P04179 222 aa20.13■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 AKAP5P24588 427 aa20.13■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 PPP2R5AQ15172 486 aa20.13■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 MAPK6Q16659 721 aa20.13■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 NECTIN4Q96NY8 510 aa20.13■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 MYH11P35749 1972 aa20.13■□□□□ 0.81
TM2D1-211ENST00000496465 PLXNA3P51805 1871 aa20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms